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fujiplot:富士图-多个GWAS结果的马戏团表示-
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2021-05-28
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:mount_fuji: 富士情节 :mount_fuji: 多个GWAS结果的马戏表演。 概述 开发了Fuji图(多个GWAS结果的马戏团表示),以有效总结数十个性状中的重要SNP( )。 从技术上讲,它是的包装脚本,可从GWAS结果生成输入数据和配置文件。 富士情节以名字命名 :mount_fuji: 公吨。 日本富士 :mount_fuji: ,其山脊和裙子与我们的身材非常相似! 要求 与和软件包。 要安装这些软件包,请在R控制台中键入install.packages("tidyverse") 。 请按照安装Circos。 对于当前版本( ),您需要应用我们的以避免文本排列中的无限循环。 或者,您可以下载并使用。 我将尽快报告此问题。 用法 请将circos添加到您的PATH或在fujiplot.R适当设置CIRCOS_PATH 。 Rscript fujiplot.R input_example/input.txt input_example/trait
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fujiplot-master.zip (28个子文件)
fujiplot-master
fujiplot.R 10KB
output
.gitkeep 0B
output_example
circos.png 1.18MB
barplot.pdf 11KB
circos.svg 703KB
config
data_tracks.conf 1KB
angle_offset.conf 21B
bands.conf 136B
karyotype.conf 53B
chromosome_order.conf 0B
ideogram_label.conf 179B
chromosome.conf 685B
ideogram.conf 337B
image.conf 525B
ticks.conf 328B
circos.conf 131B
static
colors_fonts_patterns.conf 165KB
static.conf 142B
luminance_corrected_color.conf 579B
housekeeping.conf 8KB
ucsc_color.conf 440B
main.conf 438B
LICENSE 34KB
README.md 4KB
data_tracks
.gitignore 6B
karyotypes
karyotype.human.hg19.txt 39KB
input_example
traitlist.txt 2KB
input.txt 72KB
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