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Glioblastoma
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2021-04-30
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胶质母细胞瘤的细胞系和免疫分类决定患者的预后 抽象的 背景: 缺乏胶质母细胞瘤的预后指标。 固有的肿瘤特征和微环境都可能影响癌症的预后。 我们的研究目的是产生纯胶质母细胞瘤细胞系和免疫分类,以破译胶质瘤细胞和微环境在预后中的各自作用。 方法:我们研究了两个患有胶质母细胞瘤的大型患者(TCGA n = 481和Rembrandt n = 180),并记录了临床数据,转录组谱和结果。 将129个纯胶质母细胞瘤细胞系的转录组图谱聚类,以生成胶质母细胞瘤细胞系分类。 纯免疫细胞的转录组图谱用于为每个免疫细胞生成签名。 使用去卷积确定胶质母细胞瘤细胞系和免疫细胞亚型的存在。 结果: 胶质母细胞瘤细胞系分类定义了3个新的分子组,称为致癌的,代谢的和神经元的交流丰富的。 在这两个队列中,神经元通讯丰富的肿瘤与预后不良有关。 免疫细胞浸润在间充质经典分类亚组和富含代谢物的肿瘤中更为常见。 髓细胞浸润,
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Glioblastoma-master.zip (11个子文件)
Glioblastoma-master
data
TCGA
cell_line_estimated_TCGA.txt 50KB
TCGA_res_abs.txt 256KB
TCGA_clinical.txt 83KB
cell_line_processed.txt 17.55MB
Rembrandt
res_abs_rembrandt.txt 95KB
cell_line_estimated.txt 18KB
molecular_Rembrandt.txt 3KB
info_clin_gbm.txt 50KB
Rembrandt_genes.txt 24.5MB
code
code.R 39KB
README.md 2KB
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