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abide:遵守预先计划
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2021-05-09
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预处理连接器项目/遵守###################################### 内容 download_abide_preproc.py-用于在给定表型信息的情况下从S3下载ABIDE预处理数据的脚本 map_rawout_to_organized_s3.py-用于组织来自管道运行的CPAC原始输出并以S3上的输出格式组织它们的脚本 一致 abide_cc_plots.R-R脚本,用于从ABIDE一致性数据帧中绘制成对一致性值 abide_concordances.pdf-预先处理过的ABIDE的成对一致性图(跨策略,跨管道) big_df.csv.gz-所有成对一致性的G压缩csv数据帧; 解压缩并将其传递到abide_cc_plots.R将生成abide_concordances.pdf pairwise_concordance.py-用于计算ABIDE预处理输
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abide-master.zip (39个子文件)
abide-master
freesurfer_files.json 7KB
download_abide_preproc.py 11KB
map_rawout_to_organized_s3.py 5KB
preprocessing
resources
abide_spatial_maps
PNAS_Smith09_rsn10.nii.gz 2.17MB
abide_rois
ez_mask_pad.nii.gz 13KB
aal_mask_pad.nii.gz 15KB
rois_3mm.nii.gz 6KB
ho_mask_pad.nii.gz 12KB
tt_mask_pad.nii.gz 12KB
CC200.nii.gz 12KB
CC400.nii.gz 14KB
abide_masks
Mask_ABIDE_85Percent_GM.nii.gz 17KB
strategies.obj 326B
settings
CPAC_subject_list_abide_rerun.yml 226KB
abide_spatial_maps.txt 88B
centrality_mask.txt 86B
pipeline_config_abide_rerun.yml 23KB
abide_rois.txt 497B
realigned_inputs
USM_0050473_mprage.nii.gz 22.44MB
Trinity_0050269_mprage.nii.gz 4.05MB
yamls
map_dict_rerun.yml 38.66MB
ccs_missing.yml 191KB
subs_list.yml 16KB
comparisons_list.yml 60.36MB
rerun2_subs.yml 5KB
scripts
eigen_run.sge 331B
eigen_run.py 8KB
run_cpac.py 1KB
run_cpac.sge 377B
Phenotypic_V1_0b_preprocessed1.csv 439KB
.idea
dictionaries
rcc2734.xml 403B
download_abide_preproc_guide.txt 3KB
.gitignore 717B
README.md 3KB
concordances
big_df.csv.gz 14.13MB
abide_cc_plots.R 2KB
pairwise_concordance.py 12KB
query_download_abide.py 4KB
abide_concordances.pdf 288KB
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