plass:蛋白质水平组装者（PLACE）

PLASS-蛋白质水平组装者 Plass（蛋白质级ASSembler）是一种在蛋白质水平上组装短读测序数据的软件。 Plass的主要目的是组装复杂的宏基因组数据集。 它在土壤基因组中组装的蛋白质残留量是Megahit的10倍。 Plass是GPL许可的开源软件，以C ++实现，可用于Linux和macOS。 该软件旨在在多个内核上运行。 用Plass创建土壤参考目录（SRC）和海洋真核生物参考目录（MERC）。 。 土壤参考目录（SRC）和海洋真核生物参考目录（MERC） SRC是通过组装640个土壤元基因组样本而创建的。 MERC是从TARA海洋探险队创建的元转录组学数据集中收集的。 两个目录都冗余，在90％覆盖率时减少到90％序列同一性。 每个目录是包含序列的单个FASTA文件，标头标识符包含序列读取存档（SRA）标识符。 目录可在下载。 我们在提供了一个名为“ BFD”的数