lipyd:用于脂质组学LC MSMS数据分析的Python模块

lipyd –用于脂质组学LC MS / MS数据分析的Python模块 该模块实现了用于MS / MS脂质组学数据分析的方法和工作流程。 主要在Python 3中运行，但也可以在Python 2.7.x中运行。 输入和预处理 从mzML文件中读取原始质谱数据，峰选择和特征检测时，我们依赖于库。 这可以确保通过完善的方法进行有效的计算处理。 由于我们的OpenMS集成尚未完成，我们提供了一个临时解决方案，可以从软件导出的CSV文件中读取已预处理的功能。 我们对构建昂贵的专有软件的想法不满意，并且在不久的将来，我们将提供与OpenMS的完全集成。 代谢物数据库查找 lipyd.modb模块提供了到标准数据库（如和的统一接口。此外，它还能够生成自定义的代谢物质量。 使用默认设置，数据库包含超过10万种脂质。 lipyd.lipid模块包含150多种预定义的脂质类，并且很容易定义新的脂质类。 的