ROAD：ROAD使用RNA折纸方法促进了RNA纳米结构的设计

道路：RNA折纸自动化设计 ROAD软件包使用RNA折纸方法使RNA纳米结构的设计自动化，并包括以下主要程序： RNAbuild-从蓝图生成3D PDB坐标文件。 左轮手枪-重复突变随机化的RNA起始序列，直到在ViennaRNA折叠模型下折叠成目标2D结构。 Batch_revolvr-多次运行Revolvr以为同一蓝图创建不同的候选设计。 RNAvis-分析和设计蓝图中的一条潜在折叠路径并设置其动画效果。 flip_trace-在所有四个可能的方向上输出一个蓝图。 trace_analysis-解析蓝图并输出分析和该蓝图的有用变体。 trace_pattern-解析一个蓝图，并输出该蓝图中的结构的点-原义符号以及序列约束。 它为左轮手枪创建输入。 跟踪-边线序列上的蓝图。 仅由左轮手枪使用。 引用路 在出版物中使用此软件时，请引用： 安装要求： 要运行RNAbu