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Digital_Pathology:此研究项目专注于设计图像分类工具以检测组织图像中的病理
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2021-02-25
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数字病理学 任务说明 该项目的总体目标是将组织图像分类为病变或未病变。 这些组织图像由大量单个或未患病的细胞组成。 因此,能够对整个图像进行分类不是很有用。 我有兴趣解决此问题的方法称为图像分割。 这将通过在图像上运行对象检测算法,在每个单元格周围放置一个边界框来实现。 然后,将分割后的细胞图像输入到深度神经网络分类器中,该分类器将返回代表该细胞是否患病的概率。 如果此概率超过某个阈值,则该单元格的边界框将与给定概率一起叠加在原始图像上。 方法 该程序使用自定义RCNN算法处理高分辨率图像(大约8000x12000像素)。 该模型由两个单独的深度神经网络,区域提议网络(RPN)和分类器组成。 第一步是将图像缩小(大约10倍),以便RPN可以更快地进行预测。 RPN拍摄由滑动窗口/图像金字塔方法给出的32x32px图像,并预测图像中任何单元的联合相交(IOU)。 然后将超过给定阈值的所有感
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Digital_Pathology-master.zip (12个子文件)
Digital_Pathology-master
R-CNN.py 25KB
Classifier_Prediction.jpg 402KB
ConvLSTM.py 8KB
RPN_Prediction.jpg 541KB
Architecture_Diagram.png 35KB
tissue_histology_classification.py 3KB
accuracy_experiment.py 8KB
README.md 3KB
tiles256_model.h5 1.53MB
Classify_Generated_Tiles.py 4KB
diseased_dots_0002.jpg 5.91MB
generatetiles.py 6KB
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