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genome-bin-tools:用于R中的元基因组可视化和分箱的交互式工具
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2021-05-10
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gbtools:用于R中的元基因组可视化和分箱的交互式工具 有关详细说明,请参见。 阅读发表在《微生物学前沿》上的 消息 使用gbt_checkinput() (v2.6.0)在R环境中验证输入文件,验证器不再依赖于非核心Perl模块 现在,您可以使用plot功能(v2.5.8)中的markCustomPalette=参数为plot中的分类标记指定自定义颜色。 修复了由SPAdes标头名称不一致引起的Fastg钓鱼脚本中的错误(v2.5.7) 快速开始 这是您可以使用gbtools示例数据在gbtools完成的基本操作(请看此包中的example_data/Olavius_metagenome文件夹)。 以下命令全部在R环境中。 1.安装gbtools 从源包 tar.gz归档文件可以在R_source_package文件夹中找到。 install.packages( " sp "
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genome-bin-tools:用于R中的元基因组可视化和分箱的交互式工具 (164个子文件)
AB_metabat_bins_for_gbt 130KB
CITATION 383B
CITATION 289B
CITATION 252B
HPminus.coverage 8.16MB
HPplus.coverage 7.99MB
SampleA2.covstats 5.23MB
SampleA2.covstats 5.23MB
SampleG1_error.covstats 5.2MB
SampleG1.covstats 5.2MB
SampleG1.covstats 5.2MB
AB_assem_megahit.covstats 2.01MB
DESCRIPTION 402B
.gitignore 194B
gbtools_2.6.0.tar.gz 4.55MB
gbtools_2.5.8.tar.gz 34KB
gbtools_2.5.7.tar.gz 33KB
gbtools_2.5.6.tar.gz 33KB
gbtools_2.5.5.tar.gz 33KB
gbtools_2.5.4.tar.gz 32KB
gbtools_2.5.3.tar.gz 32KB
gbtools_2.5.2.tar.gz 30KB
gbtools_2.5.1.tar.gz 30KB
gbtools_2.4.4.tar.gz 29KB
gbtools_2.4.5.tar.gz 29KB
gbtools_2.4.3.tar.gz 27KB
gbtools_2.4.2.tar.gz 24KB
gbtools_2.4.1.tar.gz 24KB
gbtools_2.4.tar.gz 23KB
gbtools_2.3.tar.gz 20KB
gbtools_2.2.tar.gz 19KB
gbtools_2.1.tar.gz 18KB
gbtools_2.0.tar.gz 15KB
LICENSE 18KB
input_validator.log 537B
README.md 6KB
metabat_bins 42KB
metawatt_bins 283KB
NAMESPACE 967B
AB_assem_megahit_blob.out 3.89MB
AB_assem_megahit_amphora2.out 427KB
AB_assem_megahit_blastn.out6 3.84MB
phylotype.result.parsed 446KB
input_validator.pl 16KB
fastg_paths_fishing.pl 12KB
get_ssu_for_genome_bin_tools.pl 12KB
blob_annotate_mod.pl 8KB
parse_phylotype_result.pl 5KB
parse_bin_fasta_files.pl 3KB
fastg_paths_fishing.pl 43B
input_validator.pl 39B
gbtools_data_structures.png 112KB
AB_plot.png 10KB
multibinplot.png 9KB
plot_cov_gc.png 8KB
plot_cov_gc_grey.png 7KB
plot_cov_gc_grey_cutoff3000.png 6KB
plot_diffcov.png 5KB
plot.gbt.R 20KB
gbt.default.R 7KB
multiBinPlot.R 5KB
generatePlotColors2.R 5KB
setOperation.gbtbin.R 5KB
tabOverlapBins.R 5KB
mergeOverlapBins.R 5KB
gbtbin.default.R 4KB
gbt_checkinput.R 3KB
generatePlotColors.R 3KB
progressiveFish.gbt.R 3KB
generateLegendColors.R 3KB
points.gbtbin.R 3KB
choosebin.gbt.R 3KB
choosebinPolygon.gbt.R 3KB
summaryLOB.R 3KB
identify.gbt.R 2KB
plot.progressiveFish.R 2KB
winnow.gbt.R 2KB
testbasic.R 2KB
importBins.R 2KB
plot.gbtbin.R 2KB
mergeScaffMarker.R 2KB
fastgFish.gbt.R 2KB
binsFromMarkers.R 2KB
summary.gbtbin.R 2KB
exportBins.R 2KB
fastgFish.R 1KB
gbt.R 1KB
print.gbtbin.R 1KB
gbtbin.R 1KB
winnowMark.gbt.R 1KB
userAdd.gbt.R 1KB
print.gbt.R 1KB
pickBinPoints.R 885B
winnowMark.R 838B
winnow.R 815B
userAdd.R 698B
choosebinPolygon.R 604B
choosebin.R 521B
write.gbt.R 516B
cexScaling.R 478B
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苏鲁定
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