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metabolomeDB:本地代谢物数据库
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2021-05-16
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代谢组学数据库 这组命令将来自Internet的文件处理为内部特定的数据库格式。 建立数据库 $ > mysql -u root < create> echo " <data> " > ALL_HMDB.xml $ > find /Users/nat2/Downloads/hmdb_metabolites/. -print | xargs -n1000 grep -h -v " <?xml version= " >> ALLHMDB.xml $ > echo " </data> " >> ALL_HMDB.xml 然后将xml文件转换为制表符分隔值文本文件。 可以通过更改文
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metabolomeDB-master.zip (7个子文件)
metabolomeDB-master
parse_hmdb.py 4KB
populate_metabolites.py 1KB
create_database.sql 600B
populate_metabolites.txt 21.4MB
README.md 3KB
20150810_meeting.sql 1KB
assign_internalids.py 3KB
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火君
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