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cell_ranger:用于单个单元格数据的cell_ranger
共12个文件
md:3个
py:3个
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2021-02-11
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介绍 mpozuelo / MGI_demux是一种生物信息学分析管道,用于将i5和i7的Illumina数据多路分解。 工作流处理来自FastQ输入( , )的原始数据以进行多路分解,有关结果的更多详细信息,请参见。 该管道是使用构建的, 是一种工作流工具,可以以非常便携的方式跨多个计算基础架构运行任务。 它带有docker容器,使安装变得简单,结果可高度重现。 快速开始 一世。 安装 ii。 安装 , 或 iii。 开始运行您自己的分析! 您需要按照“ working_directory / data / fastq / run_id / lane / run_id_lane_read {1,2} .fq.gz”的方式组织fastq文件。 然后从工作目录运行以下指令。 nextflow run mpozuelo/MGI_demux -profile < docker/s
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cell_ranger-master.zip (12个子文件)
cell_ranger-master
conf
base.config 1KB
Dockerfile 607B
nextflow.config 4KB
LICENSE 1KB
main.nf 10KB
environment.yml 293B
README.md 2KB
docs
usage.md 10KB
README.md 562B
bin
scrape_software_versions.py 4KB
modify_samplesheet.py 1KB
convertHeaders.py 5KB
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蓝色山脉
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