没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
memes:与MEME Suite的R接口
共175个文件
r:45个
rd:35个
png:30个
需积分: 11 0 下载量 56 浏览量
2021-04-02
05:49:55
上传
评论
收藏 1.1MB ZIP 举报
温馨提示
模因 工具系列的R接口,提供了多个实用程序,可用于对DNA,RNA和蛋白质序列进行基序分析。 memes的工作原理是检测MEME套件的本地安装,运行命令,然后将结果直接导入R。 安装 开发版本 您可以使用以下命令从安装memes的开发版本: if ( ! requireNamespace( " remotes " , quietly = TRUE )) install.packages( " remotes " ) remotes :: install_github( " snystrom/memes " ) Docker容器 # Get development version from dockerhub docker pull snystrom/memes_docker:devel # the -v flag is used to mount an analysis direc
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
memes:与MEME Suite的R接口 (175个子文件)
DESCRIPTION 2KB
fa1.fa 147B
fa2.fa 147B
.gitignore 163B
.gitignore 20B
.gitignore 7B
tomtom.html 369KB
dreme.html 221KB
index.html 266B
LICENSE 48B
README.md 33KB
NEWS.md 1KB
LICENSE.md 1KB
fly_factor_survey.meme 404KB
fly_factor_survey_id.meme 404KB
flyFactorSurvey_cleaned.meme 269KB
flyFactor_dups.meme 1KB
example.meme 712B
m04_DREME-4_AGWGMGAG.meme 564B
m06_DREME-6_AAAHRAAA.meme 564B
m02_DREME-2_CACACRCA.meme 564B
m03_DREME-3_TTKTTGB.meme 519B
m09_DREME-9_CTCTCTB.meme 519B
m08_DREME-8_AAADTKG.meme 519B
m01_DREME-1_DGCARC.meme 475B
m05_DREME-5_GCVAAM.meme 475B
m10_DREME-10_MAAAAY.meme 474B
m07_DREME-7_CASACA.meme 474B
NAMESPACE 3KB
todo.org 5KB
save_tomtom.png 39KB
save_ame.png 33KB
save_dreme.png 32KB
save_fimo.png 31KB
README-unnamed-chunk-16-1.png 28KB
README-unnamed-chunk-11-1.png 27KB
README-unnamed-chunk-10-1.png 27KB
README-unnamed-chunk-26-1.png 23KB
README-unnamed-chunk-25-1.png 23KB
README-unnamed-chunk-22-1.png 17KB
README-unnamed-chunk-21-1.png 17KB
README-unnamed-chunk-13-1.png 14KB
README-unnamed-chunk-17-2.png 12KB
README-unnamed-chunk-18-2.png 12KB
README-unnamed-chunk-20-1.png 11KB
README-unnamed-chunk-19-1.png 11KB
README-unnamed-chunk-17-3.png 11KB
README-unnamed-chunk-18-3.png 11KB
README-unnamed-chunk-18-1.png 11KB
README-unnamed-chunk-17-1.png 11KB
README-unnamed-chunk-6-1.png 10KB
README-unnamed-chunk-18-4.png 10KB
README-unnamed-chunk-17-4.png 10KB
README-unnamed-chunk-13-2.png 9KB
README-unnamed-chunk-12-1.png 9KB
README-unnamed-chunk-14-1.png 8KB
README-unnamed-chunk-14-2.png 7KB
README-unnamed-chunk-7-1.png 7KB
README-unnamed-chunk-13-3.png 6KB
README-unnamed-chunk-8-1.png 4KB
tomtom.R 23KB
generics.R 17KB
meme.R 14KB
fimo.R 11KB
ame.R 10KB
dreme.R 10KB
ame_methods.R 10KB
utils.R 9KB
class_utils.R 8KB
test-tomtom.R 7KB
match_utils.R 6KB
utils_internal.R 5KB
input_methods.R 5KB
data.R 5KB
plots.R 5KB
test-ame.R 4KB
motif_utils.R 4KB
test-dreme.R 4KB
remove_duplicate_motifs.R 3KB
process_utils.R 3KB
test-input_methods.R 2KB
import_xml_utils.R 2KB
import_xml.R 2KB
test-fimo.R 2KB
test-motif_utils.R 2KB
test-utils.R 2KB
test-process_error_check.R 2KB
flyFactorMotifs.R 1KB
example_rnaseq_table.R 1KB
test-xml_import.R 1KB
test-ame_methods.R 1KB
test-remove_duplicate_motifs.R 1KB
example_fimo.R 976B
example_dreme.R 976B
example_ame_large.R 962B
example_ame.R 941B
example_dreme_by_binding.R 875B
test-match_utils.R 448B
example_chip_summits.R 364B
example_tomtom.R 322B
共 175 条
- 1
- 2
资源评论
胜负欲
- 粉丝: 21
- 资源: 4642
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- Screenshot_20240522_084328_com.tencent.mm.jpg
- 附件计算机专业课选课说明-1.xlsx
- 基于TypeScript的ahousepet-admin-web管理系统设计源码
- 《广东开放大学学习指引》期末考核要求0522.zip
- mkl-2021.1.1-py2.py3-none-macosx-10-15-x86-64.whl
- mkl-2018.0.3-py2.py3-none-manylinux1-x86-64.whl
- halcon实现两幅图像相减
- mkl-2021.3.0-py2.py3-none-manylinux1-x86-64.whl
- IAR9.3主题配置,包含字体颜色等
- 才从简来.apk
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功