fimoService:meme套件的fimo（查找主题）作为微服务，用python编写，带有R和python客户端

fimoService meme套件的fimo（查找单个主题出现）作为微服务。 华盛顿大学的William Noble实验室发布了基于Motif的序列分析工具。 我们在这里提供R和python便利函数，用于在指定的DNA序列上运行 。 为了演示FIMO服务，我们使用2013年论文的示例，该示例报告了由于单碱基突变而导致的转录因子结合基序的创建。 此微服务具有简单的设计和实现： MEME套件和FIMO安装在您的本地主机上，或（在ISB上）安装在whovian上。 主题库文件可在该主机上的已知位置获得。 用Python编写的FimoServer，在指定端口上打开 REPLY套接字，并侦听ZMQ REQUEST消息 这些消息包含一个JSON命名的DNA序列列表 python FimoServer将FIMO作为单独的进程执行并收集结果。 结果被捕获到数据框（在R或python熊猫