CBMPy:基于PySCeS约束的建模-开源

PySCeS CBMPy是用于基于约束的建模和分析的新平台。 它是根据PySCeS仿真软件项目中开发的原则进行设计的：可用性，灵活性和可访问性。 CBMPy支持最新的编码标准，用于编码CBM模型编码，SBML L3 FBC，COBRA以及符合MIRIAM的RDF和自定义注释。 使用生物学家直观的数据结构，同时透明地将其转换为基础的数学结构，其体系结构既可扩展，又具有灵活性。 。 CBMPy执行流行的分析，例如FBA，FVA，元素/电荷平衡，网络分析和模型编辑，以及为生态系统建模开发的高级方法。 CBMPy通过以下方式支持用户交互：-交互式控制台或作为高级使用的库-GUI，模型的可视表示，分析方法-基于SOAP的webAPI通过Web服务公开了高级功能