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社区分析 (CP) 是一种通过关联来预测蛋白质之间功能关联的方法：如果两种蛋白质在微生物群落中共享相似的存在和缺失谱（称为群落谱），则预测它们是相关联的。 群落分析在概念上类似于功能预测的系统发育分析方法，但存在根本差异。 这个包提供了不同的配置文件构建方法和相关性指标，我们已经证明这些对于优化这种新方法的性能很重要。 算法细节请参考我们的论文：Dazhi Jiao、Wontack Han 和 Yuzhen Ye。 通过社区分析进行功能关联预测。 方法，2017