deepsignal-plant:使用来自植物的纳米Kong测序读数的信号水平特征检测甲基化

深度信号厂 一种从牛津纳米Kong测序读物中检测甲基化状态的深度学习方法。 deepsignal-plant应用BiLSTM从Nanopore读数中检测甲基化。 它基于Python3和PyTorch构建。 内容 安装 deepsignal-plant建立在和。 运行深度信号装置之前，需要使用tombo重新来自纳米Kong读取的原始信号。 先决条件： （版本1.5.1） 依存关系： （版本> = 1.2.0，<= 1.5.0？） 1.创建环境 我们强烈建议使用虚拟环境来安装deepsignal-plant及其依赖项。 可以使用如下创建和停用虚拟环境： # create conda create -n deepsignalpenv python=3.6 # activate conda activate deepsignalpenv # deactivate conda dea