lathe:利用纳米Kong长读测序从元基因组生成细菌基因组的工具

车床 利用纳米Kong长读测序从元基因组生成细菌基因组的工具 安装 首先，安装 然后安装snakemake。 这可以通过以下方式完成。 conda install snakemake snakemake --version #please ensure this is >=5.4.3 接下来，将此github目录克隆到可以永久存储的某个位置。 记住要用git pull保持更新。 git clone https://github.com/elimoss/lathe.git 可以在找到启用SLURM集群执行的说明。 典型的安装时间：5-10分钟。 更改自2021-02-03 车床已适应于同时运行多个样本，而不是每个snakemake命令仅运行一个样本。 管道现在可以从纳米Kong运行中获取.fast5原始数据，也可以接收基本的fastq文件。 配置文件已更改以反映这一点。 现在，