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用卷积滤波器matlab代码-Cell-Tracking:使用具有多任务学习功能的深度神经网络进行细胞跟踪
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2021-05-21
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用卷积滤波器matlab代码细胞追踪 使用具有多任务学习功能的深度神经网络进行细胞跟踪 版权所有(C)陶和,华茂和张艺。 版权所有。 该代码基于王乃炎,感谢他分享了他的代码。 CNN源代码来自matlab工具箱。 抽象的 细胞跟踪在生物医学和计算机视觉领域起着至关重要的作用。 由于细胞通常在显微镜图像中具有频繁的变形活动和较小的尺寸,因此在实践中跟踪非刚性和非重要细胞非常困难。 传统的视觉跟踪方法在跟踪刚性和重要视觉对象方面具有良好的性能,但是,它们不适合用于单元跟踪问题。 在本文中,提出了一种使用卷积神经网络(CNN)以及多任务学习(MTL)技术的新型细胞跟踪方法。 CNN可学习可靠的信元功能,而MTL可提高跟踪的泛化性能。 提出的细胞跟踪方法包括粒子过滤器运动模型,多任务学习观察模型和优化的模型更新策略。 在训练过程中,使用MTL技术将细胞跟踪分为在线跟踪任务和伴随的分类任务。 观察模型是通过构建CNN来学习鲁棒的细胞特征而进行训练的。 通过在显微镜图像序列的第一帧中分配细胞位置来启动跟踪过程。 然后,将粒子过滤器模型应用于在后续帧中生成一组候选边界框。 训练后的观察模型提供对应于
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Cell-Tracking-master.zip (86个子文件)
Cell-Tracking-master
affineUtility
affwarpimg.m 595B
readme.md 1B
affparam2geom.m 1KB
affparam2mat.m 1KB
affparaminv.m 452B
estwarp_condens_DLT.m 1KB
run_tracker.m 5KB
CNN
cnnnumgradcheck.m 3KB
cnnsetup.m 2KB
expand.m 2KB
cnnff.m 3KB
cnncelltest.m 360B
cnntrain.m 792B
cnnexamples.m 1KB
cnnapplygrads.m 575B
cnnbp.m 3KB
cellclassificationmain.m 1KB
cnntest.m 193B
imageUtility
interp2.mexa64 13KB
sampleNeg.m 617B
interp2.mexglx 10KB
samplePos_MTT.m 296B
interp2.cpp 4KB
interp2.dll 24KB
warpimg.m 588B
samplePos_DLT.m 415B
interp2.mexw64 10KB
initMTT.m 801B
trackparam_DLT.m 3KB
results
MTT0319_center_errors_single_object_MLM.mat 1KB
get_location.m 305B
MTT0319_center_location_MLM.mat 847B
MTT0319_success_errors_single_object_MLM.mat 2KB
get_precision_plot.m 571B
get_success_plot.m 1KB
samples
1
20160215T154015.jpg 4KB
20160215T154023.jpg 4KB
20160215T154024.jpg 4KB
20160215T154035.jpg 4KB
20160215T154028.jpg 4KB
20160215T154014.jpg 4KB
20160215T154018.jpg 4KB
20160215T154019.jpg 4KB
20160215T154022.jpg 4KB
20160215T154033.jpg 4KB
20160215T154016.jpg 4KB
20160215T154031.jpg 4KB
20160215T154027.jpg 4KB
20160215T154029.jpg 4KB
20160215T154025.jpg 4KB
20160215T154026.jpg 4KB
20160215T154034.jpg 4KB
20160215T154030.jpg 4KB
20160215T154021.jpg 4KB
20160215T154020.jpg 4KB
20160215T154032.jpg 4KB
20160215T154017.jpg 3KB
groundtruth.mat 19KB
drawUtility
drawtrackresult.m 4KB
showimgs.m 2KB
drawbox.m 1KB
README.md 3KB
util
softmax.m 256B
im2patches.m 313B
patches2im.m 242B
makeLMfilters.m 2KB
expand.m 2KB
flicker.m 208B
whiten.m 183B
visualize.m 1KB
randp.m 2KB
fliplrf.m 543B
tanh_opt.m 54B
allcomb.m 3KB
normalize.m 97B
randcorr.m 283B
myOctaveVersion.m 169B
isOctave.m 108B
sigm.m 48B
rnd.m 49B
zscore.m 137B
flipall.m 80B
flipudf.m 576B
sigmrnd.m 126B
pos_queue.m 627B
run_MTT.m 2KB
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