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matlab系统聚类代码-FishExplorer:幼虫斑马鱼钙成像数据的交互式分析
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2021-05-22
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matlab系统聚类代码 鱼探险家 :microscope: 概括 该GUI和相关脚本随附了论文“幼虫斑马鱼中神经元活动和收敛性感觉运动转换的全脑组织”(另请参见biorxiv)。 GUI的开发目的是交互式地浏览和可视化功能成像数据。 就选择单元格或时间点的子集而言,可以在GUI中快速整理数据。 可以快速连续地对可视化的确切数据子集执行不同的分析。 这个平台极大地简化了簿记和可视化,并且被开发用于制作许多对单个动物数据进行操作的自定义分析的原型。 关联的脚本扩展了相同的分析框架,以跨动物组进行分析。 也可以在MATLAB工作区(请参见demo \ demo_workspace_interactive.m)或脚本形式(请参见demo \ demo_script.m)中轻松编辑GUI中策划的所有数据。 导入回GUI以进行进一步的探索和可视化。 资料详情 数据由幼虫斑马鱼的全脑记录组成,这些记录在虚拟环境中表现为虚拟,并使用光片显微镜成像。 硬件系统在Vladimirov,Mu,Kawashima,Bennett,Yang,Looger,Keller,Freeman和Ahrens的《自然方法》(2014年)中有详
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