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matlabauc代码-ctrp-reference:用于癌症治疗React门户网站(CTRP;http://portals.b...
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2021-05-24
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Matlab的耳语ctrp参考 README的主要页面与Implement.zip中的(静态)参考实现有关,在本书的一章中进行了介绍。 该空间中的子文件夹对应于后续的独立工作产品,如这些子文件夹中的README文件中所述。 MATLAB参考实施了癌症治疗React门户网站(CTRP;)中基于结果的基础数据分析程序,该程序提供了源自癌细胞系小分子敏感性分析的分析结果。 运行参考实现所需的数据和元数据(implement.zip)可从美国国家癌症研究所(NCI)癌症基因组学办公室(OCG)免费下载,最初是作为“癌症靶点发现”支持工作的一部分而产生的和发展(CTD ^ 2)研究中心网络。 要使用该代码,请在MATLAB搜索路径可见的位置下载并解压缩参考实现(implement.zip)。 接下来,从ftp://caftpd.nci.nih.gov/pub/OCG-DCC/CTD2/Broad/下载数据。 将以下文件放在“数据”子文件夹中:v20.data.per_cpd_pre_qc.txt,v21.data.auc_sensitiveivities.txt,v21.data.gex_avg
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ctrp-reference-master.zip (44个子文件)
ctrp-reference-master
implement.zip 58KB
LICENSE 1KB
auc
new-abs-auc-with-qc.txt 14.68MB
publicRefitCTRPv2AUC.m 9KB
fun
cooksdist.m 2KB
df
DFtostruct.m 2KB
DFrmcol.m 884B
DFtomat.m 893B
DFwrite.m 11KB
DFfrommat.m 917B
DFrenamecol.m 3KB
DFview.m 5KB
DFindex.m 8KB
DFjoin.m 8KB
DFaddindex.m 4KB
DFvalues.m 1014B
DFverify.m 2KB
DFgetgood.m 1022B
DFkeepcol.m 2KB
DFunmerge.m 4KB
DFkeeprow.m 1KB
DFsort.m 3KB
Contents.m 3KB
DFread.m 23KB
DFcat.m 4KB
DFisnum.m 1KB
DFfilter.m 2KB
util
strsplithy.m 2KB
rowcol2well.m 1KB
well2rowcol.m 1KB
getfirst.m 521B
well2id.m 1KB
notindex.m 1KB
uniquenotmiss.m 3KB
cell2delim.m 1KB
makevert.m 808B
isint.m 814B
getlast.m 513B
num2colidx.m 545B
conv2str.m 3KB
sig3upper.m 309B
sig2both.m 266B
README.md 1KB
README.md 3KB
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