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阈值分割后显示分割区域MATLAB代码-cersuit:紧身衣
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2021-05-26
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阈值分割后显示分割区域MATLAB代码紧身衣 小脑椎间盘切除术。 在容器中,管道安装在/opt/cersuit目录中。 Matlab代码在src目录中,入口点是src/cersuit.m 。 在bin可以在没有Matlab许可证的情况下在奇异容器中使用的已编译Matlab代码。 有关基本SPM12和SUIT Matlab软件的链接,参考和许可信息,请参见external目录。 也用于图像文件操作和创建质量检查PDF。 该容器具有SPM12(已编译)和FSL的完整安装。 SUIT参考 管道 使用fslreorient2std将源T1文件调整为轴向数据排序,以满足SUIT工具箱的要求。 将提供的灰质图像与SPM12的灰质概率图集(TPM.nii)进行仅平移对齐。 这是通过对齐重心来实现的。 不估计旋转量,以避免SUIT的边界框计算出现问题。 提供的灰度图像必须与提供的T1对齐。 估计的注册将保存到文件中,并也应用于T1。 SUIT估算T1小脑区到SUIT地图集的仿射变换和翘曲。 将T1和相关图像重新采样到SUIT地图集空间。 灰度和白质图像在有和没有雅可比调制的情况下都进行了重新采样。 将
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cersuit-master.zip (32个子文件)
cersuit-master
shell_simg.sh 202B
external
LICENCE_SPM12.txt 19KB
README_SUIT.md 4KB
README.txt 677B
.gitignore 36B
src
xwrapper.sh 379B
regional_volumes.m 1KB
find_center_of_mass.m 258B
init_coreg_translation_only.m 1KB
cersuit.m 847B
cersuit_main.m 4KB
init_coreg.m 1KB
initial_reorient.sh 100B
organize_outputs.m 728B
make_pdf.sh 8KB
apply_reverse_coreg.m 268B
transform_native_to_SUIT.m 2KB
apply_init_coreg.m 258B
transform_SUIT_to_native.m 2KB
build
compile_matlab.sh 1KB
spm_make_standalone_local.m 4KB
README.md 5KB
Singularity.v2.1.0 3KB
.gitignore 44B
bin
.gitattributes 46B
run_spm12.sh 873B
spm12 55KB
spm12.ctf 134B
mccExcludedFiles.log 102B
requiredMCRProducts.txt 30B
readme.txt 3KB
singularity_examples.sh 1KB
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