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DFT的matlab源代码-DBSTEP:基于DFT的Steric参数-基于python的工具,可从基本上任何结构格式中提取分子...
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2021-05-26
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DFT的matlab源代码 DBSTEP 基于DFT的Steric参数 允许用户从化学结构计算空间参数。 计算Sterimol参数1 (L,Bmin,Bmax),%埋入体积2 ,Sterimol2Vec和Vol2Vec参数 特征 使用输入选项从分子结构文件计算所需的空间参数: -s或--sterimol -Sterimol参数(L,Bmin,Bmax) -b或--volume百分比 -s或--sterimol AND --scan [rmin:rmax:interval] -Sterimol2Vec参数 -b或--volume AND --scan [rmin:rmax:interval] -Vol2Vec参数 -r调整埋入体积百分比测量的半径(默认3.5埃) 使用--exclude [atom indices]选项排除空间测量中的--exclude [atom indices] (无空格,以逗号分隔) 立体参数可以通过范德华半径或使用三维网格(默认为网格)来计算。 使用--measure ['classic' or 'grid']更改测量类型,其中classic将使用vdw半径。 网
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DBSTEP-master.zip (50个子文件)
DBSTEP-master
setup.py 972B
.gitignore 54B
Example3.png 159KB
MANIFEST.in 73B
Example2.png 254KB
SUPPORT.md 776B
setup.cfg 67B
LICENSE.txt 1KB
dbstep
writer.py 7KB
requirements.txt 23B
__init__.py 167B
mcgowan.csv 2KB
parse_data.py 8KB
sterics.py 15KB
examples
CH2iPr.xyz 724B
4ClPh.xyz 625B
Ad.xyz 1KB
iPr.xyz 574B
CEt3.xyz 1KB
Me.xyz 108B
Et.xyz 164B
1Nap.xyz 351B
Bn.xyz 769B
Ph.xyz 622B
CHiPr2.xyz 1KB
4MeOPh.xyz 822B
CHEt2.xyz 870B
tBu.xyz 721B
DBLOOP 110B
4MePh.xyz 772B
Benchmark.csv 1KB
35diMePh.xyz 922B
CHPr2.xyz 1KB
H.xyz 130B
nBu.xyz 246B
smiles.txt 64B
CH2tBu.xyz 871B
cHex.xyz 918B
nPr.xyz 574B
constants.py 2KB
graph.py 7KB
Dbstep.py 26KB
__main__.py 407B
calculator.py 9KB
DBSTEP_graphic.png 155KB
README.md 11KB
Example1.png 155KB
DBSTEP_banner.png 215KB
sterimol.f 55KB
meta.yaml 818B
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