等额本金matlab代码-MCPCA_PopGen:MCPCA_PopGen

等额本金matlab代码MCPCA_PopGen 介绍 中低深度测序具有成本效益，并且允许研究人员以降低基因型识别准确度为代价来增加样本量。 为了在下游分析中纳入不确定性并保持统计能力，我们引入了 MCPCA_PopGen 来分析低深度测序数据。 该方法使用剂量而不是基因型来解释基因型调用的不确定性。 它进一步优化了剂量非线性变换的选择，以最大化协方差矩阵的 Ky-Fan 范数。 MCPCA_PopGen 是一个开源包。 MCPCA 的源代码由 Soheil Feizi 使用 Matlab 提供（可用 ）。 为了更容易安装和实现，我们用 Julia 语言编写了整个包 MCPCA_PopGen。 该软件包包括以下文件： main.jl：关于将 MCPCA_PopGen 应用于剂量数据的示例。 MCPCA_PopGen.jl, Discretize.jl : MCPCA_PopGen 方法 MCPCA_sample_disc_wrapper.jl、MCPCA_sample_disc.jl、utils.jl：Julia 语言中的 MCPCA 方法。 getJenksBreaks.R, jen