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Open Reading Frame Figure Generator:从 DNA 序列生成开放阅读框表示-matlab开发
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2021-05-30
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尽管 MATLAB 具有从核苷酸序列预测开放阅读框 (ORF) 的工具,但它们都没有直接在单个图中生成 ORF 的可视化表示。 该程序将序列结构作为输入,预测每个序列中的 ORF,并绘制它们的三帧(仅正)表示。 参数 isRef 可以方便地将 ORFfigure 转换为比较工具,其中第一个序列用作参考,局部对齐确定每个 seq 条目与参考之间的匹配,颜色匹配序列为蓝色,不匹配序列为红色。 该软件可以轻松比较核苷酸变异如何影响目标基因的翻译。
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