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R软件代码转换为matlab-SimKern:Python代码库,用于生成和探索用于机器学习的基于相似性的内核
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2021-05-21
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R软件代码转换为matlab 内容 介绍 主菜单 SIM0基因组创建 SIM1相似性排列 SIM0机器学习 SIM1机器学习 SIM0 SIM1组合机学习 分步示例 再现手稿的机器学习结果 介绍 该程序旨在模拟基因组的排列并使用机器学习算法分析结果。 该系统可以接收一个文件,该文件包含一系列微分方程,网络流模型或代表单元或其他复杂系统的布尔网络。 创建此文件上的排列后,将通过第三方程序(Matlab,Octave或R)运行它们,以记录要在标准机器学习模型中使用的每个排列的标量结果。 该过程称为SIM0,排列称为基因组。 在称为SIM1的过程中,可以在每个基因组上运行一组单独的置换,并在分析输出后,可以确定基因组之间的相似性得分。 然后建立一个相似度矩阵,使其有资格进行内核化机器学习。 SIM0和SIM1的最后一部分是对生成的所有数据执行机器学习。 在此过程中,将生成一个图表以显示每个结果。 该程序的所有输出,包括SIM0和SIM1的每个文件的结果,相应的相似度和输出矩阵以及创建的基因组文件,都将输出到用户选择的目录中。 为了使用该程序生成基因组文件并获得响应,必须满足几个要求。 用户必
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R软件代码转换为matlab-SimKern:Python代码库,用于生成和探索用于机器学习的基于相似性的内核 (152个子文件)
Sim1SimilarityMatrixfinalHIGHERQUALITY.csv 14.19MB
Sim1SimilarityMatrixfinal.csv 14.19MB
Sim1SimilarityMatrixfinal.csv 13.35MB
Sim1worseSimMatrix.csv 4.49MB
Sim1betterSimMatrix.csv 4.49MB
Sim1nominalSimMatrix.csv 4.49MB
Sim1biasedSimMatrix.csv 4.49MB
Sim1SimilarityMatrixfinal.csv 3.54MB
Sim1SimilarityMatrixfinal.csv 2.56MB
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Sim0GenomesMatrix.csv 314KB
Sim0GenomesMatrix.csv 313KB
Sim0GenomesMatrix.csv 99KB
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Sim0GenomesMatrix.csv 63KB
BoolNetGenomesMatrixSample.csv 5KB
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Sim0Output.csv 4KB
Sim0Output.csv 4KB
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f4.m 8KB
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linearProgrammingModel.octave 2KB
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FileProcessingServiceIT.py 13KB
__main__.py 13KB
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