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matlab自相关代码-polyloc:基于检测点的自相关函数的粒子跟踪链接算法
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2021-05-23
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matlab自相关代码快速概述 这是我尝试的2D间隔拍摄电影中用于单个粒子跟踪的链接算法。 该基本思想是从观察得出的,通常情况下,即使没有事先知道通常轨迹的样子,通常在用3D图(两个空间和一个时间维度)绘制视频中所有检测到的点时,也可以通过肉眼清楚地看到粒子轨迹。喜欢或哪些检测可能是噪音。 通过使用所有检测的3D自相关函数,捕获这种不可知论的方法似乎效果很好,从而使我们了解了轨迹的样子。 使用此自相关函数对实际检测值(被视为峰峰值的集合)进行卷积会在3D空间中产生密度函数,此时轨迹显示为高密度的连接簇。 这些可以通过阈值化和分水岭的组合来找到。 用法 首先,请下载存储库并将其中的所有内容添加到MatLab路径中。 然后执行 trajs = find_trajs('checkACF', true); 这将提示您选择一个包含检测数据的文件并运行算法。 辅助/公用事业 auxiliary文件夹包含一些有用的代码段,这些代码段既可以由主算法使用,也可以单独使用(例如vol3d和progressbar),或者在使用主代码时非常有用,例如生成散点图。检测,汇总来自多部电影的检测(请参阅下文)。 片
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polyloc-master.zip (30个子文件)
polyloc-master
LICENSE 1KB
polyloc
map4frame.m 2KB
acfDataStorage.m 325B
detections_addBins.m 1003B
duplicate_times.m 526B
postprocess_conflicts.m 2KB
try_relinking.m 1KB
load_data.m 5KB
get_mapSpec.m 921B
conflicting_trajs.mat 30KB
detections_from_conflict.m 1KB
clusters2trajs.m 2KB
find_trajs.m 11KB
acf3d.m 3KB
find_clusters.m 3KB
link_clusters.m 3KB
clean_conflicts.m 2KB
acf_interactive.mlapp 143KB
acf_interactive_block.png 185KB
clean_acf.m 2KB
auxiliary
synthetic_acfData.m 2KB
vol3d.m 7KB
pairwise_diff.m 2KB
aggregate_detections.m 5KB
msd_from_detections.m 7KB
progressbar.m 3KB
vol3d_license.txt 1KB
trajs2txt.m 290B
scatter_detections.m 833B
README.md 5KB
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