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功率谱密度函数MATLAB代码-snn_analysis:snn_analysis
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2021-06-08
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功率谱密度函数 MATLAB代码数据驱动的、特定于神经元类型的 CA3 SNN 的分析 该存储库包含有关如何分析海马亚区 CA3 的全尺寸尖峰神经网络 (SNN) 模型的信息。 以下说明假定用户已安装 MATLAB 并且他们已根据此处列出的说明安装了 CARLsim。 选择要分析的网络 有三个目录反映了可以分析的 CA3 SNN 的类型: ,提供代码来分析保持神经元和连接类型特异性的全尺寸基线 SNN; 提供代码来分析保持神经元类型特异性同时去除连接类型特异性的全尺寸类 SNN; 提供分析全尺寸原型 SNN 的代码,该 SNN 保持连接类型特异性,同时去除神经元类型特异性。 网络独立分析说明 在执行任何分析之前,必须创建一个包含模拟输出的目录。 主要分析功能采用目录结构,其中模拟输出文件夹位于其自己的单独目录中,并且该目录应驻留在正在分析所选网络类型的分析代码的位置(例如,在基线分析目录中)。 移动到安装了 CARLsim MATLAB 分析工具箱 (MAT) 的目录并运行 initOAT 命令,该命令提供执行分析所需的功能。 cd MAT_directory initOAT 移动到您
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snn_analysis-main.zip (77个子文件)
snn_analysis-main
archetype_analysis
computePS_filtered.m 8KB
getspikephase.m 1009B
circ_confmean.m 2KB
createModeSummaryPlots.m 3KB
computeCycleSPCLFP.m 10KB
circ_std.m 1KB
computePeaks.m 1KB
firstApproxLFP.m 3KB
computePopStats.m 20KB
gini.m 5KB
evaluateSim.m 9KB
computeSPCFilteredLFP.m 5KB
plotNetworkRaster.m 4KB
createLFPPlots.m 15KB
circ_rtest.m 2KB
simpleSpikeStats.m 1KB
readNMsim.m 1KB
circ_mean.m 1KB
circ_r.m 2KB
readBinnedSpikeData.m 1KB
computeSynapseCount.m 2KB
createFigure3Plots.m 6KB
findMinISI.m 2KB
findLFPPeaks.m 6KB
formatSpikes.m 932B
class_analysis
computePS_filtered.m 8KB
getspikephase.m 1009B
circ_confmean.m 2KB
createModeSummaryPlots.m 3KB
computeCycleSPCLFP.m 10KB
circ_std.m 1KB
computePeaks.m 1KB
firstApproxLFP.m 3KB
computePopStats.m 20KB
gini.m 5KB
evaluateSim.m 10KB
computeSPCFilteredLFP.m 6KB
plotNetworkRaster.m 4KB
createLFPPlots.m 15KB
circ_rtest.m 2KB
simpleSpikeStats.m 1KB
readNMsim.m 1KB
circ_mean.m 1KB
circ_r.m 2KB
readBinnedSpikeData.m 1KB
computeSynapseCount.m 2KB
createFigure3Plots.m 6KB
findMinISI.m 2KB
findLFPPeaks.m 6KB
formatSpikes.m 932B
ca3net_parameters.xlsm 80KB
README.md 3KB
baseline_analysis
computePS_filtered.m 8KB
getspikephase.m 1009B
circ_confmean.m 2KB
createModeSummaryPlots.m 3KB
computeCycleSPCLFP.m 10KB
circ_std.m 1KB
computePeaks.m 1KB
firstApproxLFP.m 3KB
computePopStats.m 20KB
gini.m 5KB
evaluateSim.m 10KB
computeSPCFilteredLFP.m 6KB
plotNetworkRaster.m 4KB
createLFPPlots.m 15KB
circ_rtest.m 2KB
simpleSpikeStats.m 1KB
readNMsim.m 1KB
circ_mean.m 1KB
circ_r.m 2KB
readBinnedSpikeData.m 1KB
computeSynapseCount.m 2KB
createFigure3Plots.m 6KB
findMinISI.m 2KB
findLFPPeaks.m 6KB
formatSpikes.m 932B
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