DFT的matlab源代码-Psi4-OpenMM-Interface:Psi4和OpenMM之间的最小接口允许在每个程序之间传...

DFT的matlab源代码Psi4-OpenMM接口 Psi4和OpenMM之间的最小接口，允许在每个程序之间传递系统。 此外，还包括一些有用的工具，例如球形添加溶剂（因为在OpenMM中addSolvent不能添加除水以外的其他溶剂），键长，角度，二面角的计算以及独特的构象搜索。 用法示例 在将计算结果转换为在溶剂中进行React的实验数据时，考虑溶剂相互作用至关重要。 为了动态考虑溶剂，可以使用OpenMM进行分子力学模拟，并发现各种溶剂构象。 当使用量子力学方法（如果您有许多溶剂分子时，可能是DFT）计算单点能量时，可以确定特别稳定的（重要的）构象。 找到了这种工作流程的示例实现。 在此，以氯仿为模型模拟了清水扭转平衡。 单个氯仿分子最稳定的配置之一，每个B3LYP的扭力平衡表示为使用VMD的溶剂可及表面，以便在视觉上使氯仿紧密配合到扭力平衡中。 Psi4 1.1论文和佐治亚科技新闻中也代表了该应用程序。 如何安装 由于Github和Conda都提供了功能，因此使用此程序包非常容易。 “安装”此软件包非常简单（希望如此）。 在执行以下任何步骤之前，如果您没有Conda，请安装它。