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基于信息内容的核小体定位分析与预测
基于信息内容的核小体定位分析与预测
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2021-02-23
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基于信息内容的核小体定位分析与预测
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iNuc-PseKNC:基于序列的预测子,用于预测具有伪k元组核苷酸组成的基因组中核小体的定位
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动机:核小体定位参与许多细胞活动,并在调节细胞过程中发挥重要作用。 随着在后基因组时代产生的基因组序列的雪崩,迫切需要开发用于快速有效地鉴定核小体定位的自动化方法。 尽管提出了一些计算方法,但大多数计算方法是物种特异性的,并且忽略了可能在确定DNA序列上核小体定位中起重要作用的内在局部结构性质。 结果:在这里开发了一种名为“ iNuc-PseKNC”的预测子,用于预测智人,秀丽隐杆线虫和果蝇果蝇基
使用多样性增量结合二次判别分析预测核小体DNA的形成潜力和核小体的定位
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在这项工作中,基于基因组核苷酸的k-mer频率,开发了一种基于多样性增加与二次判别分析(IDQD)相结合的区分核小体DNA和接头DNA的新方法。 当用于预测形成核小体的DNA潜力时,该模型对于酿酒酵母,智人和果蝇果蝇的准确度分别达到94.94%,77.60%和86.81%。 对于酿酒酵母,我们的分类器的接收器操作员特征曲线下的面积为0.982。 我们的结果表明,DNA序列偏好对于核小体形成潜力至关
基于支持向量机(SVM)的酵母核小体定位的预测
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多样性增量结合支持向量机方法预测酵母核小体定位
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基于matlab的核小体定位高效数据处理实现.pdf
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位置相关评分功能预测酿酒酵母中核小体的占有率
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接下来,该算法被用于预测整个酿酒酵母基因组中的核小体占有率,并获得了与核小体定位实验图相对较高的相关系数。 此外,证实了在调控位点附近的独特的核小体耗尽区域。 结果表明,接头区域内在的DNA序列偏好对核小...
原核生物大肠杆菌基因组序列形成核小体能力的预测 (2013年)
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以大肠杆菌基因组为研究对象,基于体外组装的核小体序列中k-mers频数信息,采用多样性增量结合二...对大肠杆菌、酵母和人类基因组中核小体定位序列与缺失序列中偏好的k-mers进行了比较,结果表明核小体缺失序列更为保守。
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##### 2.15 模糊小波神经网络预测和分类 ##### 2.16 GRU预测和分类 ### 3 图像处理算法 **3.1 图像识别** 3.1.1 车牌、交通标志识别(新能源、国内外、复杂环境下车牌) 3.1.2 发票、身份证、银行卡识别 3.1.3...
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核小体定位是真核基因转录调控的重要途径。 为了彻底了解基因表达的调控,必须考虑核小体的定位。 核小体位置与基因表达调控之间的关系是表观遗传学的研究重点。 因此,有必要建立一个快速,准确的在线核小体预测...
MetrixForComplexity:使用无损音频压缩算法来测量音乐消息的信息内容。 这种基于“最小长度描述”的方法为音乐的复杂性提供了定量的度量,可以分析音乐中的微观,中间和宏观尺度的冗余。 给定音乐信息随时间推移的复杂性可视化可以用作音乐学研究的工具
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MetrixForComplexity 使用无损音频压缩算法来测量音乐消息的信息内容。 这种基于“最小长度描述”的方法为音乐的复杂性提供了定量的度量,可以分析音乐中的微观,中间和宏观尺度的冗余。 给定音乐消息随时间变化的复杂性可视化可以用作音乐学研究的工具。 要求 Python:numpy,scypi,matplotlib Flac编解码器位于
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