提出一种改进的SortMatAlign算法, 通过快速排序预处理距离矩阵, 使MatAlign算法的时间复杂度由O(N4)降为O(N3). 结果表明, SortMatAlign 算法计算出的RMSD值平均是MatAlign算法的1. 098 倍, 使用残基个数和RMSD综合衡量标准的S值平均是MatAlign 算法的0. 968倍, 在同等条件下, 运行速度比MatAlign 提高18. 276 倍.
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