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matlab有些代码不运行-Zcells:来自明场显微镜Z堆栈图像的通用细胞分割
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2021-05-23
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matlab有些代码不运行Zcells Zcells是一种基于Z堆栈的显微图像分割技术,灵感来自高光谱成像。 有关同一内容的更多信息,请访问Wiki或在此处阅读相关文章:。 可以在以下位置找到经过整理的数据集:。 重要信息:我们强烈建议使用此存储库的randomforest分支,因为它的运行速度始终比master分支快。 另外,请使用最新的提交版本,而不是1.0版本,因为此后已纠正了许多错误。 我们即将发布1.1版,但在此之前我们仍想添加许多功能。 整个过程分为两个主要部分,训练和预测。 因此,有两个主要的用户脚本,training_script.m和prediction_script.m,我们将在以下各节中讨论。 有关每个函数及其采用和返回的参数的更多详细信息,您可以阅读源代码的相关部分,并在注释中进行说明。 训练阶段 要启动培训,只需移至Zcells文件夹的根目录,然后在Matlab中键入以下命令(需要R2017a版本或更高版本) training_script 标记Zstacks 将弹出一个GUI窗口,您可以在其中加载新的和未标记的Zstack,甚至可以加载一些已经标记的Zsta
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Zcells-master.zip (63个子文件)
Zcells-master
prediction_script.m 2KB
utilities
format_results.m 524B
imborders.m 856B
LoadAndExtract.m 6KB
runthroughstack.m 7KB
evalparams.m 503B
tifToMatStack.m 2KB
process_framessubselection.m 826B
misc
enableDisableFig.m 7KB
varycolor.m 2KB
dirtypointer.m 166B
v73me.m 628B
hex2color.m 824B
color2hex.m 139B
watershed_meyer.mexa64 69KB
mysoftmax.m 108B
dirtyreference.m 318B
multicompact.m 127B
distinguishable_colors.m 6KB
pimpmystrings.m 925B
grs2rgb.m 2KB
FulltoROI.m 282B
relative2full.m 1KB
ROItoFull.m 264B
full2relative.m 1001B
BundleData.m 1KB
preprocessing.m 2KB
saveResults.m 905B
UnBundleData.m 579B
process_subselection.m 824B
plotConfMat.m 2KB
prediction
predictionDisplayGUI
show_conf.m 2KB
predictionDisplayGUI.m 25KB
show_classes.m 2KB
predictionDisplayGUI.fig 10.12MB
RunPrediction.m 6KB
evalutation_script.m 5KB
README.md 4KB
training
saveTrainedSet.m 1KB
training.m 9KB
trainingSetGUI
initialize_training_params.m 2KB
updateClassesBox.m 420B
nbpixels_inclass.m 413B
preprocessing_ops_GUI.m 12KB
plot_hierarchy_tree.m 748B
nodes_from_hierarchy.m 293B
compile_data.m 6KB
training_params_GUI.m 44KB
SelectClass.m 2KB
updateGUI.m 4KB
pixels_selection_GUI.fig 61KB
training_params_GUI.fig 79KB
hierarchy_checkup.m 487B
udapte_zpxtext.m 314B
Edit_class_GUI.fig 23KB
pixels_selection_GUI.m 31KB
preprocessing_ops_GUI.fig 52KB
Edit_class_GUI.m 19KB
stack2map.m 187B
createOrLoadTrainingSet.m 935B
training_script.m 995B
google_drive
README.md 414B
.gitignore 355B
共 63 条
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weixin_38643212
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