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idl代码与Matlab-3D-tomography-to-network:该项目导入水凝胶颗粒的断层摄影切片,对其进行分离和标...
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2021-05-26
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idl代码与Matlab 3D断层扫描到网络 该项目导入水凝胶颗粒的层析切片,使用分水岭分割对其进行分离和标记,并跟踪接触和变形以获取力网络和织物信息。 这段代码是用Matlab编写的。 如有疑问,请通过以下方式与我联系 文件“ raw_input_image.jpg”显示了我们系统的典型光学切片,其中包含来自散射的噪声和线条伪影。 Matlab代码的第一部分将导入这些图像,并使用FFT过滤器分别对其进行过滤,最终结果是二进制化的图像“ filtered_binary_image.jpg”。 可选地,非本地均值滤波器可以很好地平滑图像噪声。 可以在其他Matlab存储库中找到此类过滤器。 该代码为每个重建的粒子输出粒子文件,包括粒子的质心和表面体素。 代码的后半部分使用此信息使用接触力学从接触区域计算粒子接触(重叠)和相应的接触网络(织物张量)和应力张量。 要获取粒子轨迹(时间序列数据),可以使用粒子跟踪代码,例如John Crocker,David Grier和Eric Weeks开发的代码:
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3D-tomography-to-network-master.zip (7个子文件)
3D-tomography-to-network-master
README.md 1KB
filtered_binary_image.jpg 37KB
tomography_to_network.m 14KB
split_seqs.pl 1KB
raw_input_image.jpg 751KB
smoothedparticle.png 101KB
smooth2a.m 3KB
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