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register_H:该程序旨在将重建的前列腺病理注册到体内 MRI-matlab开发
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2021-05-29
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此功能可获取H&E图像(运动图像)并对其进行处理用于体内前列腺成像(固定图像)的相关研究。 H&E 的注释已填充,以提高可见性,并将其缩放为实际尺寸由 ImageScope 软件的测量确定扫描组织学并通过使用像素间距转换为像素在 DICOM 标头中找到的数据。 使用控制点注册, 沿前列腺轮廓手动设置 8 个控制点,以及分段线性仿射变换,H&E 被拉伸到体内前列腺形状。 通过手动创建图像来测试注册验证前列腺轮廓的遮罩,比较轮廓重叠在 5 毫米分辨率,并按百分比面积重叠计算。 定性地, 还创建了透明和棋盘格覆盖。 格里森等级数据被格式化以用于 ROC 曲线分析 - 它被转换成一维数组。 该程序需要一个包含 MRI 和组织学的目录您要注册的图像。 组织学上的注释应为如下:绿色 [0 255 0] 代表格里森得分 3; 蓝色 [0 0 255] 格里森得分 4; 红色 [255 0 0] 代表格里
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