rpcamatlab代码-gemelli:Gemelli是一个工具箱，用于在稀疏成分组学数据集上运行稳健的AitchisonPC...

rpca matlab代码 杰梅利 Gemelli是一个工具箱，用于在稀疏成分组学数据集上运行稳健的Aitchison PCA（RPCA）和成分张量因式分解（CTF）。 RPCA可用于横截面数据集，其中每个主题仅采样一次。 CTF可以用于重复测量数据，其中每个对象都被采样了多次（例如，纵向采样）。 两种方法均旨在描述样本/受试者的变异以及将它们分开的生物学特征。 RPCA和CTF的预处理转换都是健壮的中心对数比转换（rlcr），可解决稀疏数据（即许多缺失/零值）的问题。 可以找到有关rclr的详细信息，还可以找到该转换的交互式介绍。 简而言之，rclr对数在居中之前先转换观察到的（非零）值。 然后，RPCA和CTF仅对rclr转换后的观测值执行矩阵或张量分解，这与对密集数据执行的相似。 安装 要安装最新版本的gemelli，请运行以下命令 # pip (only supported for QIIME2 >= 2018.8) pip install gemelli 注意：gemelli与python 2不兼容，并且与Python 3.4或更高版本兼容。 文献资料 Gemelli可以独立