rpcamatlab代码-DEICODE:稀疏计数数据的强大AitchisonPCA

rpca matlab代码 DEICODE是一个工具箱，用于在稀疏的成分组学数据集上运行Robust Aitchison PCA，将特定功能链接到β-多样性排序。 安装 要安装最新版本的Deicode，请运行以下命令 # pip (only supported for QIIME2 >= 2018.8) pip install deicode # conda (only supported for QIIME2 >= 2019.1) conda install -c conda-forge deicode 注意：deicode与python 2不兼容，并且与Python 3.4或更高版本兼容。 deicode当前处于Alpha状态。 我们正在积极开发它，并且可能会发生向后不兼容的接口更改。 在内部使用DEICODE 可以找到QIIME2论坛教程。 可以找到官方的插件文档和教程。 可以在中找到回购教程。 使用DEICODE作为独立工具 deicode中有两个命令。 第一个是rpca ，第二个是auto-rpca 。 唯一的区别是auto-rpca自动估算矩阵的基础等级，并且不需要n_co