发酵食品是人类饮食的重要组成之一，其中豆豉风味独特，富含多种生理活性物质。微生物在食品发酵过程中起着极为重要的作用。作者选择云南豆豉为研究对象，使用焦磷酸高通量测序，可以全面地分析豆豉中的细菌群落，能够得到其中稀少群落(rare biosphere)的信息。乳酸杆菌是丰度最高的细菌，占总序列数的72％，在豆豉发酵中起重要作用；芽孢杆菌也是重要的细菌，占序列总数的10％。此外，还发现了属于人类致病菌(Shigella flexneri)和植物病原菌(Erwinia persicina)的序列，显示出传统方法
