matlab更改代码字体快人
描述
一个R包,可直接从PLINK输出文件中使用QQ和Manhattan绘图快速高效地可视化GWAS结果。
快速:与qqman相比,大大减少了情节生成的时间。
在一个典型的估算的PLINK
assoc文件中,该文件包含1000万个SNP,绘图时间从qqman中的737s减少到60s。
高效:优化的内存管理
多功能:可以处理从p值,p值的对数到FST分数的各种输入。
与其他全基因组群体遗传参数(例如FST,pi和D统计数据)兼容的绘图。
允许双面得分,例如带有负值的得分。
非模型友好:对非模型生物(通常具有数百个重叠群或许多支架)的基因组,字母顺序和其他排序选项的结果的额外支持。
注释和突出显示通用性:具有多种选项,可自定义感兴趣的注释和突出显示SNP。
熟悉:与qqman相比,具有一组非常相似的输入参数和代码结构。
职能:
1.快人
描述
直接从PLINK
assoc输出(或具有染色体,位置和p值的任何数据框)直接创建曼哈顿图。
用法
fastman
(m,
chr
=
"CHR",
bp
=
"BP",
p
=
"P",
snp,
chrlabs,
sp
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