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matlab三角分布代码-multipripser:即将内置的用于ripser的hackypython接口,带有一些多处理功能
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2021-05-28
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matlab三角分布代码这是什么? 这是的Python3接口,是用于计算Vietoris-Rips持久性条形码的快速软件。 除非您已经安装了该代码,否则几乎是一文不值。 为什么要这样? 据我所知,Ripser不是多线程的。 对于我正在工作的特定项目,需要许多概率密度实现的条形码。 因此,我想使用多处理程序包对其进行并行化。 就是说,自2019年3月4日起,我注意到PyPI上现在有一个ripser python软件包; 需要进行一些调查,以查看它在速度,可视化等方面是否比我们做的更好/更糟糕。如果他们做的是“聪明”的事情并直接编译ripser代码并与之交互,则不会感到惊讶一种更好的方法,而不是使用外部ripser二进制文件。 要求 Python套件: 麻木 matplotlib scikit学习 多重处理,操作系统,子流程(应内置) ...最重要的是, ripser可执行文件,它是C ++代码,需要自己编译。 它是如何工作的? Ripser接收文本文件进行输入; 最好是csv(逗号分隔值)格式的距离矩阵的下三角。 输出到stdout(终端),列出您感兴趣的PH尺寸的出生/死亡时间。这是目
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multipripser-master.zip (29个子文件)
multipripser-master
.gitignore 67B
blah2.py 268B
create_distmat_str.py 349B
blah.py 1KB
__init__.py 0B
TODO 657B
create_distmat.py 389B
ri_ex1.py 442B
single_sequence_scaling.py 2KB
cantor_parallel.py 1KB
examples
square_parallel.py 822B
disk_parallel.py 2KB
sierpinski_single_scaling.py 787B
run_ripser_sim.py 3KB
README.md 3KB
ri_ex2_figure.png 257KB
ripser_interface.py 564B
l_systems
__init__.py 58B
sierpinski.py 2KB
sierpinski_ternary.py 768B
sierpinski_randomsamp.py 507B
ripser_misc.py 8KB
ri_ex2.py 2KB
minimal_ex2.py 341B
read_ripser_results.py 2KB
create_distmat_file.py 792B
cantor_interval_parallel.py 1KB
measures.py 3KB
gen_pt_cloud_from_measure.py 419B
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weixin_38609732
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