大量的转录组数据提供了机会1）在人群水平上验证通常从单个实验获得的基因调控机制； 2）揭示人群水平的基因调控机制； 3）建立定量的基因调控机制。 在细菌中研究最深入的调节机制之一是群体感应（QS），它在调节细菌种群行为（如抗生素产生，生物膜形成，生物发光，能力，结合，运动性和孢子形成）中起重要作用。 铜绿假单胞菌是引起植物，动物，人类疾病的革兰氏阴性细菌，其生物膜和耐药性成为临床上的关注焦点。 铜绿假单胞菌具有三个QS系统，其中包括一个用于假单胞菌的QS系统。 在这项研究中，铜绿假单胞菌的转录组数据来自104个出版物，并在不同的实验条件下分析了QS基因的表达。 结果证明了QS基因在种群水平上的定量调控机制，包括：1）根据其活性对QS相关基因进行排名和分组； 2）定量定义单个全球监管机构的角色； 3）找出全局调节子影响QS基因的可能性以及QS基因对全局调节子作出反应的可能性； 4）在四种实验条件下寻找重叠的基因。 这些结果提供了有关在人群水平上了解QS基因调控的综合信息。
