matlabr2012b代码-RExGC:使用基因聚类（RExGC）检索实验

Matlab R2012b代码RExGC 使用基因聚类（RExGC）检索实验 该文件描述了下载，处理和分析以下数据的工作流程： Blomstedt，P.，Dutta，R.，Seth，S.，Brazma，A.和Kaski，S.（2016）。 基于建模的实验检索：基因表达聚类的案例研究。 生物信息学， 32 （9），1388–1394。 该存储库中的文件也可以从发布者的网页上获得。 该代码在MATLAB（R2012b或更高版本）中运行，并已在linux中进行了设计和测试。 对于演示，请运行demo.m脚本。 数据集与以下子文件夹一起存储在Data文件夹中 EFO：EFO数据的csv文件 MAT：从下面的MATLAB函数输出生成的mat文件 TAB：从Expression Atlas下载的基因表达数据的选项卡文件。 由于空间原因，这些选项卡文件（〜20GB）未预先存储，但可以使用步骤1中提供的R脚本进行下载。 注意！ 步骤1是用于下载和预处理数据的预备步骤，可能需要花费大量时间才能运行。 步骤2和4b需要提供在步骤1中下载的数据。要使用基于2014年6月4日下载的预处理数据集，可以省略步骤1