生成树的matlab代码-TieDIE:子网扩散捆绑（TieDIE）

生成树的matlab代码TieDIE：捆绑扩散，用于子网发现。 当前版本 1.0 作者 Evan O. Paull，Daniel Carlin和Joshua M. Stuart。 其他贡献者 Srikanth Bezawada（TieDIE Cytoscape插件）Josh L. Espinoza（快速内核加载功能）Dana Silverbush（MATLAB内核生成代码更新到较新版本） 要求 使用预先计算的扩散内核时，需要Python 2.7和python numpy模块来运行tietie可执行文件。 扩散内核计算需要使用MATLAB或Python scipy模块（版本0.12或更高版本）：扩散内核计算是免费的，尽管计算效率不如MATLAB实现。 ：所有模块。 ：> = 0.12.0内核生成 ：内核生成 安装 安装依赖项 将TieDIE资料库下载到所需位置 （推荐）使用MATLAB预先生成内核文件（bin / makeKernel.sh） 运行TieDIE / bin / tiedie 例子 GBM.test提供了一个来自胶质母细胞瘤的示例信号网络（TCGA Network，2012