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matlabfcm函数代码-clustering:探索聚类方法的项目
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2021-05-26
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matlab fcm函数代码聚类 探索聚类方法的项目 背景 该存储库包含Matei关于群集的Rmd讲座。 我还建议您下载Young / Old FlowRepository数据集。 为此: 安装FlowRepositoryR软件包 使用该程序包,检索FR-FCM-ZZGS数据集 查看此git存储库中的代码,以获取有关如何进行质量控制和数据预选门的建议/指导 之后,玩得开心! 尝试FlowSOM。 考虑一下您自己的聚类和总体识别想法。 寻找在新老受试者之间差异显着的T细胞亚群。 年轻/旧数据集 该数据集由美国纽约州罗彻斯特市的David H. Smith疫苗生物学与免疫学中心罗彻斯特人体免疫学中心创建。 目的是使用SWIFT的竞争性聚类分配方法来测量老年人/年轻人中PBMC亚群之间的差异。 SWIFT是一种非常好的聚类方法,可在MATLAB中实现,如所述。 不幸的是,由于它是在MATLAB(这是一个可商购的系统)中实现的,因此您可能无法自己运行它。 但是,您可以将结果与已发布的SWIFT结果进行比较。 质量控制和门控 此仓库中包含三个包含我的R代码的文件。 yo_utils.R 该文件包
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clustering-master.zip (11个子文件)
clustering-master
clustering_flow.Rmd 14KB
qc_raw.png 417KB
README.html 1.84MB
qc_gated.png 447KB
figs_for_clustering.R 7KB
get_yo_dataset.R 357B
README.md 6KB
gate_data.R 1KB
yo_utils.R 32KB
clustering_flow.html 12.89MB
survey_data.R 6KB
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