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用matlab运行MD5代码-vPECA-:vPECA-
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2021-06-17
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用matlab运行MD5代码vPECA vPECA 是一种通过配对表达和染色质可及性数据的变体解释方法,可以识别活性和活性选择的调控元件及其基因调控网络。 1. 数据可用性 “高海拔缺氧适应的染色质可及性景观和调控网络”中的数据组织具有三个基本组成部分。 (1) 元数据电子表格 Summay_info_of_HUVEC_data.xlsx 中提供了元数据电子表格,其中包含四个子表格,即 NGS、RNA-seq、ATAC-seq 和 Hi-C。 元数据是指关于整个研究、单个样本、所有协议以及对已处理和原始数据文件名的引用的描述性信息。 通过填写元数据模板电子表格的所有字段来提供信息。 电子表格中提供了有关每个字段内容的指南。 使用的参考程序集 (hg19) 在元数据电子表格中提供。 (2) 原始数据 原始数据文件是包含读数和质量分数的原始文件,由 Illumina 测序仪器生成。 原始数据文件格式为 FASTQ。 我们为所有数据文件提供 MD5 校验和。 校验和用于验证文件完整性。 本研究中产生的所有 RAW 数据和处理过的数据都已永久保存在 GSA 数据库中,项目 ID 为 PRJCA
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vPECA--master.zip (14个子文件)
vPECA--master
estimate_selection.m 3KB
estimate_selection_parameter.m 525B
TGfun.m 1KB
README.md 5KB
Data
Symbol.txt 73KB
HUVEC_FPKM.txt 4.38MB
element_SNP_use.txt 14.75MB
Element_name.txt 1.19MB
main_vPECA.m 4KB
main_vPECA.m 5KB
alphabetagama2.m 3KB
test.m 2KB
coeff_t_test.m 336B
Summay info of HUVEC data.xlsx 22KB
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