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微管相关蛋白1轻链3(microtubule-associated protein 1 light chain 3, LC3)是哺乳动物细胞中酵母自噬相关基因8(ATG8)的同源物,其LC3B亚型的表达强度与自噬泡数量的多少成正相关,为自噬发生的标志蛋白之一。应用RACE-PCR技术克隆了婺源荷包红鲤LC3B基因的cDNA全长序列,用RT-PCR方法检测了该基因在荷包红鲤主要组织中的表达,并用Real-time quantitative PCR方法检测了该基因在镉胁迫下转录水平的变化,以初步揭示该基因在镉
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第 37卷 第 6 期
2013年 12月
南昌大学学报(理科版)
Journal of Nanchang University (Natural Science)
Vol. 37 No . 6
Dec2013
文章编号:1006-0464(013)06-0570-07
荷包红鲤自噬相关基因LC3B的克隆及
在重金属镉胁迫下的表达
高 典 〃 ,隗 黎 丽 2 , 许 珍 娥 1b , 刘 申 1 b , 乔 盼 盼 ib
( 1 南昌大学a.医学院;b.免疫与生物治疗研究所,江西南昌 330006;
2. 江西农业大学动物科学技术学院,江 西 南 昌 330045)
摘 要 :微管相关蛋白1 轻链3(microtubule-associated protein 1 light chain 3 ,L C 3 )是哺乳动物细胞中酵母自職相
关基因8 C A T G 8 ) 的同源物,其 L C 3 B 亚型的表达强度与自噬泡数量的多少成正相关,为自噬发生的标志蛋白之一。
应用R A C E - P C R 技术克隆了婺源荷包红鲤L C 3 B 基因的c D N A 全长序列,用 R T - P C R 方法检测了该基因在荷包
红鲤主要组织中的表达,并用Real-tme quantitative P C R 方法检测了该基因在镉胁迫下转录水平的变化,以初步揭
示该基因在镉胁迫下的作用。结果表明,荷包红鲤L C 3 B 基因c D N A 全长为2 138 b p ,其中开放阅读框长378 b p ,
编码1 2 5 个氨基酸,预测分子量为14. 73 k D a ,等电点为8. 76 。序列比对显示,其编码的氨基酸序列和斑马鱼L C 3 B
具有最高的一致性和相似性,并在系统发育树上聚为一支。该基因在荷包红鲤肌肉、脑、鳃、脾脏、肝脏、血液、头
肾、肾脏和心脏组织中均有表达;在镉胁迫下,镉诱导显著影响了该基因在肾脏组织中的转录水平。L C 3 B 基因参
与的自噬反应可能参与了抗镉毒性作用。
关键词:微管相关蛋白1 轻链3; 自噬;镉;重金属;荷包红鲤
中图分类号:Q958.8 文献标志码:A
Molecular cloning,characterization and expression analysis of LC3B
from purse red common carp (Cyprinus carpio) exposed to cadmium
G A O D i a n la* , W E I Lilt , X U Z h e n e lh,L I U S h e n lh Q I A O P a n p a n lb
(1a. Medical College of Nanchang University,Nanchang 330006,China;
lb. Institute of Immunotherapy,Nanchang University, Nanchang 330006 ,China;
2. College of Animal Science and Technology,Jiangxi Agricultural University,Nanchang 330045,China)
Abstract : L C 3 (microtubule-associated protein 1 light chain 3) , located in a u t o p h a g o s o m e m e m b r a n e s after
process ing ,serves as a majo r a u t o p h a g y marke r. In this s t u d y ,w e isolated i t s L C 3 B isform f r o m c o m m o n
carp (cyprinus carpio) ,o n e of the m o s t imp or tan t industrial aquatic animals i n C h i n a using rapid amplifica
tion of c D N A ends ( R A C E ) . T h e c D N A of L C 3 B g ene is 2138-nt in l engt h,containing a 378-nt o p e n read
ing frame. T h e putative L C 3 B en co des a peptide of 125 a m i n o acids, w i th a calculated molecula r w e i g h t of
14. 73 k D a a n d an isoelectric point of 8. 76. Multiple se qu enc e alignment s h o w e d that the d e d uc e d a m i n o
acid sequenc e of c o m m o n carp L C 3 B h a d the highest seque nce identity (95. 2 % ) a n d similarity (96. 8 % ) to
that of zebrafish. In a phylogenetic tree b ase d o n a m i n o acid sequences f r o m fish , m a m m a lia n , a v i a n a n d a m
phibian L C 3 genes, the L C 3 proteins f r o m different species w e r e divided into three s u b g r o u p s ( L C 3 A ,
L C 3 B a n d L C 3 C ) . T h e c o m m o n carp L C 3 B f o r m e d a phylogenetic cluster wit h zebrafish,the n other verte
brates. T h e m R N A transcript level of L C 3 B w a s detected in mus cle , brain, gills, spleen, liver, blood, h e ad
k idne y ,ki d ney a n d heart tissues b y R T - P C R analysis. L C 3 B m R N A transcript level in kidne y w a s found
收稿• 期:2013-09-30。
基金项目!国家自然科学基金项目(3 1 0 011 2 8 ) 江西省自然科学基金项目(2 n 0 G Q Y 0 2 0 9 );江西省科技支撑计划项目
(010 BSB0 3001 );江 西省教育厅科 学基金项目(GJJ1105 3) ;南 昌 大 学 (省级)创新创业训练计划项目
(201310403036)。
作者简介:高 典 (1979— ),男,博士,讲师。E-mail:gaodian@ncu. edu. cn。
第 6 期 高 典 等 :荷包红鲤自噬相关基因LC3B的克隆及在重金属镉胁迫下的表达 571 •
significantly elevated after exp o sur e to c a d m i u m . T h i s w a s m a r k e d l y affected b y e xpo s ure concentration,
;c o m m o n carp
not b y exp osu r e time.
K e y w o r d s : L C 3 B ; a u t o p h a g y ; c a d m i u m ; h e a vy metal
自噬(a u t o p h a g y ) ,又 称 为 细 胞 自 我消 化 (cellu-
lar self-digestion),是 广 泛 存 在 于 真 核 生 物 中 的 、依
赖细 胞 自 身 溶 酶体以降解、清 除 、回收利用胞内大分
子和受损细 胞器的生理病理过程[1]。根据胞内物质
转 运 到 溶 酶 体 内 降 解 途 径的 不 同,自 噬 可 分 为 3 种
类 型 ••大 自噬(m a c r o a u t o p h a g y )、分子伴侣介导的自
噬 (c hape ron-me dia ted a u t o p h a g y ,C M A ) 和微自噬
( m i c r o a u t o p h a g y ) 。 目前,对 大 自 噬 调 节 机 制 的 研
究 相 对 透 彻 ,一 般 所 说 的 自 噬 即 为 大 自 噬 [2]。在机
体正 常 的生 长、发 育 条 件 下 ,细胞内自噬发生水肀较
低 ,在 胞 内 物质 的 更 新 和维 持 内稳 态方面 起 重 要 作
用[3];在 受 到 饥 饿 、缺 氧 、高 温 、氧化损伤等外来压力
的 胁 迫 时,自噬水¥ 显 著 上 升 ,以减少外来刺激对机
体的损伤作用 。
目前,在酵母 和 哺 乳类的自 噬 发 生过程 中 ,约有
30 几 种 自 噬 相 关 基 因 ( autophagy-related g e n e s ,
A T G s ) 参 与 了 其 中 的 调 控 作 用 。其 中 ,微 管 相关蛋
白 1 轻链 3 [microtubule-associated protein 1 light
chain 3 ,L C 3 ; 酵 母 中 名 为 A T G 8 ]定 位 于 前 自 噬 泡
和自 噬 泡膜 表 面,调控 微 管 蛋白的 组 装和去 组 装,参
与 了 自 噬 体 的 形 成 。L C 3 有 3 种 亚 型 :L C 3 A 、
L C 3 B 和 L C 3 C 。但 自 噬 水 肀 升 高 时 ,仅 L C 3 B 和增
加 的 自 噬 泡 数 目 相 关 ,因 此 L C 3 B 亚 型 是 自 噬 发生
的标志蛋白之一M 。
在激 发 机体 产 生 自 噬 的因 素 中 ,重 金 属 镉 (c a d
m i u m ) 是 一种重要的诱 导剂[7]。镉广泛存在于土壤
和 水 体 中 ,工 业 生 产 过 程 中 如 印 染 、冶 金 、电池生产
等可产生大量的镉 污染M 。在 分 子、细胞水¥ ,镉胁
迫 可阻 碍 线 粒 体的 氧 化 磷 酸 化作 用、抑制抗氧 化 酶
的活性、产生 大 量 的 活 性 氧 、损 伤 D N A 并抑制相关
的修复作用[Mn]。镉 毒 性 效 应 和 其 作 用 的 浓 度 、时
间及动物模型和细胞类型都有关系。一般认为低浓
度 暴露 (0. 5 ‘M ) 可 促 进 细 胞 增 殖 、诱 导 细 胞 凋 亡 ,
中等浓度暴露(10 ‘M ) 可 激 发 细 胞 自 噬 ,更 高 浓 度
的镉( 0 ‘M ) 可 导 致 细 胞 坏 死 [11 ]。 中等水肀的自
噬 可 抑 制 凋 亡 性细 胞 死亡 ,更 多 自噬 泡的 产生 则增
大 了 细 胞 毒 性 ,导 致 细胞死亡[12]。
关 于 自 噬 在 镉 胁 迫 下 的 适 应 性 保 护 作 用 机 制 ,
在 高 等 动 物 及 其 细 胞 内 的 研 究 已 经 取 得 一 定 进
展[7’13]。例 如 ,在 肾 小 球 系 膜 细 胞 (M E S - 1 3 ) 中 ,镉
通过钙离子 通道 诱 导 了细胞自噬[1|];在肺上皮成纤
维 细 胞 ( R W I 3 8 ) 中 ,镉 通 过 p 3 8 激 酶 的激活诱导了
细 胞 自 噬 ,促进了 A T G 5 和 L C 3 ' 表 达 水 肀 的 上
升[13]。在 鱼 类 、贝 类 等 低 等 动 物 中 ,细胞自 噬 研究
刚 刚 开 始 ,现 有 的报 道集 中于 自噬 在生 长发 育中 的
必要作用角色和病理条件下的自噬相关基因表达的
检 测 等 ,自 噬 在 抗 重 金 属 毒 性 方 面 的 研 究 鲜 有 报
道[16]8]。婺源荷包红鲤鱼是鲤鱼一个重要的地方品
种 ,可 作 为 许 多 鲤 杂 交 品 种 的 母 本 ,具 有 较 高 的食
用 、观赏和科学 研究价值[19!|],本研究以其为研究对
象 ,克 隆 了 自 噬 发 生 的 重 要 标 志 基 因 L C 3 B ,并检测
了 它 在镉 胁 迫 下 的 表 达 情 况 ,以 初 步 探 索其 在 镉 毒
害作用中 的 保 护作用 角 色。
1 材料与方法
1. 1 材料
R N A 提取试剂盒 T R I z o l reagent 购自 Invitro-
g e n 公 司 ,第 一 链 c D N A 合 成 试 剂 盒 S M A R T P C R
c D N A Synthesis Kit 购自 C lonte ch 公 司 ,逆转录试
剂盒 R e v e r t A i d T M Fi r s t S t r a n d c D N A Synthesis
K i t 购 自 F e r m e n t a s 公 司 ,D N A 分 子 质 量 标 准
( D L 2 0 0 0 ) 、S Y B R G r e e n Real-time P C R Ma s t e r
M i x 购 自 T a k a r a 公 司 ,镉 [3 ( C d S O 彳) . 8 H 2O ]购自
S i g m a 公司 。
1 . 2 总 R N A 的提取
实 验 用鱼 取 自 婺 源 荷 包 红 鲤 鱼 研 究 所 ,实验室
静 养 1 周 后 取 肾 脏 组 织 100 m g ,根 据 T R I z o l 试剂
盒 的 说 明 书 提 取 总 R N A 。
1 . 3 鲤 L C 3 B 全 长 c D N A 序列的获得
1 . 3 . 1 鲤 L C 3 B 基 因 c D N A 中 间 片 段 的 获 得 根
据 S M A R T P C R c D N A Synthesis Kit 合 成 第一链
S M A R T c D N A 。根 据 已 知 的 斑 马 鱼 (D a n i o rerio,
G e n B a n k accession no. N M _ 1 9 9 6 0 4 . 1 ) ,非 洲 爪 瞻
( X e w o p w s laevis,G e n B a n k accession no. N M _
001 0 95609 . 1 ) 和 鸡 (G aZZ ws gallus,G e n B a n k acces
sion no. N M _ 0 0 1 0 3 1 4 6 1 . 1 ) L C 3 B 基因 的 保 守 序 列 ,
设 计 荷 包 红 鲤 L C 3 B 基 因 的 正 、反 向 引 物 L C 3 F 和
L C 3 R (表 1 ) ,并 以 S M A R T c D N A 为 模 板 ,扩增鲤
L C 3 B 基 因 的 c D N A 中 间 片 段 。该 P C R 反 应 的扩
增 参 数 是 : 4 °C变 性 5 m i n 后 ,94 E 40 s,62 E 40
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