% This script needs the file Fsir.m to run
% Fsir.m contains the differential equation model
% S is the number of Susceptible individuals at each time step
% I is the number of Infected individuals at each time step
% R is the number of Recovered individuals at each time step
N=1000; %Population Size
%-- initial condictions
i0=5; % initial condition for I
s0=N-i0; % initial condition for S
r0=0; % initial condition for R
% --
T=100; % evaluation time
%-- parameters
beta=0.2; % infectious rate
gamma= 0.05; % recover rate
%--
S0I0R0=[s0 i0 r0]; % initial condictions Vector
Tspam=[0:0.1:T]; % time interval
%-- Numerical Integration
[T,Y] = ode45(@(t,Y) Fsir(t,Y,beta,gamma,N),Tspam,S0I0R0);
%--
S=Y(:,1); % Solution S
I=Y(:,2); % Solution I
R=Y(:,3); % Solution R (other solution is R=N-S-I)
%----- plots -----
plot(T,S,'k');
hold on;
grid on;
plot(T,I,'r--');
plot(T,R,'b-.');
title(['SIR model with parameters: \beta= ',num2str(beta),', \gamma= ',num2str(gamma), ', N=',num2str(N)])
xlabel('Time')
ylabel('Number of Individuals')
legend('S','I','R','Location','best')
%------------------
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