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序列比对算法综述(有兴趣的看看)
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序列比对算法
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介绍序列比对算法,将序列比对中的问题提出,有兴趣的看看
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使用动态规划化方法实现序列比对算法,有详细注解
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生物DNA序列比对算法研究!!!生物DNA序列比对算法研究!!!生物DNA序列比对算法研究!!!
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生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的
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双序列全局比对算法与双序列局部比对算法
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使用Perl编程语言实现了双序列全局比对Needleman Wunsch算法,以及双序列局部比对Smith Waterman算法。该资源也可在github上下载:https://github.com/GouXiangJian/two_seq_alignment
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序列比对是生物信息学研究的一个基本...本文给出了生物序列比对问题的定义 ,综述了目前常用的各类比对算法 ,并对每一类算法的 优缺点以及应用范围进行了分析 ,最后指出序列比对算法目前存在的问题以及未来的发展方向.
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自适应蚁群算法摘要 :序列 比对是生物信息学的重要研究-rg。蚁群算法是一种新型的模拟进化算法,并被成功地应用于旅行商问题(TSP) 等组合优化问题中。该文将蚁群算法应用于序列比对,并提出基于 自适应调整信息素...
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针对用BaumWelch算法训练隐马尔可夫模型用于序列比对算法的搜索空间有限性容易陷入局部最优点的缺陷,提出一种用量子粒子群优化算法训练隐马尔可夫模型的生物多序列比对新方法。该方法克服了BaumWelch算法在收敛...
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在分析现有立体匹配方法的基础上,提出一种基于双序列比对算法的立体图像匹配方法。将立体图像对中同名极线上的像素灰度值看做是一对字符序列,使用基于动态规划思想的双序列比对算法对这些对字符序列进行匹配,以获取立体图像视差。为验证该方法的可行性和适用性,采用人脸立体图像对进行实验。实验结果表明,使用该方法进行立体图像匹配能获得光滑的、稠密的视差图。基于动态规划思想的双序列比对算法能够有效地解决立体图像匹配
论文研究-双序列比对的算法研究.pdf
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双序列比对是生物信息学中最基本的问题之一,其研究方法是设计具有针对性的有效算法对两个DNA或蛋白质序列进行比较,找出两者之间的最大相似性匹配进而判断其是否具有同源性。详尽分析了双序列比对的实际意义,提出...
基于动态规划的快速序列比对算法
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本文在分析介绍儿种相关动态规划算法的基础上,提出了一种基于动态规划的 快速序列比对算法UKKYA。
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CS410人工智能(B类)2021-2022秋季学期的个人大作业,内容是应用三种算法(动态规划、A*、遗传算法)分别解决多序列比对问题。其中包括database、query和所有的源码。
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多重序列比对是生物信息学特别是生物序列分析中一个重要的基本操作。...另外在该算法的基础上,提出了基于分治策略的多序列比对蚁群求解算法,不但减少了原算法的计算时间,而且显著改善了算法所求得的解的质量。
两条序列进行全局比对
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DTW(Dynamic Time Warping)算法被广泛应用于序列数据比对,以度量序列间距离,但算法较高的时间复杂度限制了其在长序列比对上的应用。提出基于自适应搜索窗口的序列相似比对算法(ADTW),算法利用分段聚集平均...
这是一款专门用于序列比对的软件。 由于其序列比对显示的结果非常清楚,很多文献中的序列比对结果正是通过DNAMAN来呈现的。
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