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生物序列比对算法研究现状与展望

序列比对是生物信息学研究的一个基本方法 ,寻求更快更灵敏的序列比对算法一直是生物信息学 研究的热点.本文给出了生物序列比对问题的定义 ,综述了目前常用的各类比对算法 ,并对每一类算法的 优缺点以及应用范围进行了分析 ,最后指出序列比对算法目前存在的问题以及未来的发展方向.
2010-12-26 上传大小:272KB
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生物DNA序列比对算法研究

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BioXM 2.6 序列比对

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基于MATLAB生物信息学序列比对

将人类HEXA基因和老鼠的作比对,发现差异,有利于疾病根源的确定。

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一种多搜索策略的多生物序列比对自适应遗传算法.pdf

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序列比对软件

生物软件 序列比对软件 源代码没有

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生物序列比对

生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测,物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。

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dnaman生物软件

dnaman 生物软件 DNA蛋白质序列分析,比对

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蛋白质三维结构构建 Cn3D 4.1

Cn3D是一个生物分子的三维结构,序列比对及序列比对结果的可视化工具,可将结构与序列信息紧密结合起来,可以通过基于结构的序列比较来显示生物分子结构之间的比较

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DNAman 5.0 win7兼容

生物医疗行业常用于DNA、RNA、蛋白序列序列比对软件

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隐马尔可夫模型在多序列比对中的应用

序列的多重比对是生物序列分析研究中的一个重要方法。文章首先介绍了HMM 的基本结构,然后着重讨论了HMM 在DNA 序列之间的多重比对中的应用。

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sequencher DNA序列比对分析软件

一款DNA序列比对的软件,可用于DNA序列的分析、比对,酶切位点的查找等。

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深度学习在图像识别中的研究进展与展望

深度学习在图像识别中的研究进展与展望,对深度学习在图像识别中的应用讲解的比较好。

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GenomeCompiler

这是一款生物分子分析软件,可以进行序列比对,酶切位点识别以及引物设计

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DNAMAN v6[1].0.40&48_KG.rar

是一个应用非常普遍的生物软件,可进行序列比对,绘制载体图谱等。

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基因序列对比

类基因由4种核苷酸 分别用字母ACTG表示 要求编写一个程序 按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度 即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG 它们有多相似呢 测量两个基因的相似度一种方法称为对齐 使用对齐方法可以在基因的适当位置加入空格 让两个基因的长度相等 然后根据基因的分值矩阵计算分数 A C G T A 5 1 2 1 3 C 1 5 3 2 4 G 2 3 5 2 2 T 1 2 2 5 1 3 4 2 1 比较AGTGATG与GTTAG 第一种对齐方案为: 首先可以给AGTATG插入一个空格得:AGTAT G GTTAG插入3个空格即得: GT TAG 上面的匹配分值为: 3+5+5+ 2 + 3 +5+ 3 +5 9 第二种对齐方案为: AGTGATG GTTA G 得到的分值为: 3 +5+5+ 2 +5+ 1 +5 14 当然还有其它对齐方式 但以上对齐方式是最优的 所以两个基因的相似度就为14 ">类基因由4种核苷酸 分别用字母ACTG表示 要求编写一个程序 按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度 即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG 它们有多相似呢 测量两个基因的相似度一种方法称为对齐 使用对齐方 [更多]

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