大家好,我是小马老师。
本文介绍ovito计算并输出原子配位数的方法。
ovito提供了Voronoi分析方法,可以分析原子的配位数、原子体积,也可以进行多面体分析。
使用Voronoi方法计算配位数的流程为:
(1)导入dump文件,在Add modification选项选择“Voronoi analysis"
选择这个命令后,点击左下方的“Particles”,在原子信息列表中会自动显示每个原子的坐标、配位数、体积、半径。
(2)点击File菜单,选择“Export File”,在弹出窗口底部选择lammps dump类型的文件可导出新的dump文件。
输入文件名后,在弹出的窗口中选择新的dump文件包含的原子信息,把“Coordination”选中。
(3)打开dump文件,最后一列就是每个原子的配位数。
公众号:lammps加油站