结构域蛋白

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结构域蛋白

: 甲基化CpG结合结构域蛋白的原核表达及应用 (2014年) 本文构建了甲基化CpG结合结构域(MBD)蛋白的原核表达质粒,并表达了GST- MBD融合蛋白,采用GST柱对该融合蛋白进行纯化.体外pull-down实验发现,GST- MBD 融合蛋白能够与小鼠胚胎成纤维细胞MEF中oct4基因的启动子DNA结合,...
评级：0 浏览量：65 收藏量：0 资源大小：354KB 上传时间：2021-04-28

: 基于主成分分析的多结构域蛋白质构象的分簇算法基于主成分分析的多结构域蛋白质构象的分簇算法，文彬，张志勇，：包含多个结构域的蛋白质在溶液中通常能够存在各种不同的构象状态，这可能与它们的生物学功能密切相关。除了实验技术外，计算方
评级：0 浏览量：160 收藏量：0 资源大小：535KB 上传时间：2020-02-12

: 氨甲环酸与Wnt信号通路中含kringle结构域蛋白的结合对新生小鼠骨密度的影响 (2005年) 通过与脂蛋白相关蛋白5和最近新发现的一种含kringle结构域的蛋白kremen形成三聚体复合物．这种复合物随即被细胞内吞，从而导致细胞表面Wnt受体脂蛋白相关蛋白5水平迅速下降，从而达到抑制Wnt信号通路的日地．通过对...
评级：0 浏览量：57 收藏量：0 资源大小：415KB 上传时间：2021-05-21

: 利用pfamscan api实现调用远程pfamscan批量预测蛋白质结构域..zip 蛋白质也是构成多种生理活性的物质，如免疫球蛋白，具有维持机体正常免疫功能的作用。蛋白质的合成是指生物按照从脱氧核糖核酸（DNA）转录得到的信使核糖核酸（mRNA）上的遗传信息合成蛋白质的过程。这个过程包括...
评级：0 浏览量：11 收藏量：0 资源大小：10KB 上传时间：2024-05-20

: 蛋白质CC结构域Marcoil linux 安装报错iostream.h fstream.h No such file or directory 解决安装问题
评级：0 浏览量：633 收藏量：0 资源大小：103KB 上传时间：2016-08-03

: DOG 1.0：蛋白质功能结构域组成示意图的绘制工具 DOG 1.0：蛋白质功能结构域组成示意图的绘制工具，任间，高新娇，在这个工作中，我们为实验学家制作了一个新的软件-DOG工具（功能结构域制图软件，1.0版本）。这个软件可以精确的表示蛋白质结构域�
评级：0 浏览量：1694 收藏量：1 资源大小：252KB 上传时间：2020-03-03

: 抗凋亡和促凋亡蛋白结构域的分析因此，对抗凋亡蛋白和促凋亡蛋白结构域的分析将有助于我们更好地了解凋亡蛋白的致病机理。在这项工作中，基于UniprotKB \ SWISS-PROT数据库构建了一个数据集。该数据库包括239种抗凋亡蛋白和222种促凋亡蛋白。 ...
评级：0 浏览量：103 收藏量：0 资源大小：78KB 上传时间：2021-03-06

: MetaDomain:短序列的蛋白质结构域分类-开源 MetaDomain是一种蛋白质域分类工具，专为非常短的下一代测序读取而设计。与最新的配置文件隐马尔可夫模型（配置文件HMM）对齐工具相比，在从短序列中识别编码域时，它具有更高的灵敏度和较低的误报率。
评级：0 浏览量：101 收藏量：0 资源大小：69KB 上传时间：2021-04-29

: PADDLE:使用PADDLE预测转录因子激活结构域区域 PADDLE是从蛋白质序列预测转录因子激活结构域区域的工具。 PADDLE是一个深度卷积神经网络，经过酵母中的高通量激活测定数据训练，可以准确预测激活域的位置和强度。已通过实验验证可预测人类细胞中人类蛋白质区域...
评级：0 浏览量：511 收藏量：1 资源大小：8.37MB 上传时间：2021-04-05

: BiosynMLMatching:蛋白质结构域的匹配函数 BiosynML匹配蛋白质结构域的匹配函数
评级：0 浏览量：39 收藏量：0 资源大小：4.48MB 上传时间：2021-07-03

: 人Pokemon蛋白锌指结构域的表达与纯化人Pokemon蛋白锌指结构域的表达与纯化，杨予涛，徐志卿，目的：原核表达Pokemon基因的锌指结构域，纯化获得GST-Zinc finger的融合蛋白。方法：以人胶质瘤T98G细胞的cDNA为模板，利用PCR扩增带有BamHI�
评级：0 浏览量：92 收藏量：0 资源大小：340KB 上传时间：2020-01-02

: 论文研究-一种集成结构域和复合物信息的蛋白质功能预测方法 .pdf 一种集成结构域和复合物信息的蛋白质功能预测方法，蔡娟，李敏，蛋白质功能预测计算方法研究是近年来计算生物学中的一个重要问题，吸引了全世界科学工作者的兴趣和广泛关注。其中一类重要的方法
评级：0 浏览量：142 收藏量：0 资源大小：424KB 上传时间：2019-08-16

: 论文研究 - 高等植物蛋白的保守免疫球蛋白结构域相似性使用生物信息学工具在高等植物序列中搜索免疫球蛋白结构域相似性的痕迹，以寻找可能的早期系统发生结构关系。通过17种选择程序以及使用JavaScript，PHP，Windows程序和CDD进行保守域搜索的抗冗余序列相关方法，对...
评级：0 浏览量：135 收藏量：0 资源大小：4.16MB 上传时间：2020-05-14

: 基于距离的最大熵预测蛋白质结构域的新方法在实验和计算结构生物学中，检测蛋白质结构域的边界都是一项重要且具有挑战性的任务。在本文中，提出了一种仅从序列信息中检测蛋白质的域结构的有前途的方法。该方法基于分析从数据库搜索得到的多个序列比对。 ...
评级：0 浏览量：107 收藏量：0 资源大小：320KB 上传时间：2021-02-22

: 基于可信数据集和结构域证据的人类细胞外基质蛋白质预测软件.zip 基于可信数据集和结构域证据的人类细胞外基质蛋白质预测软件蛋白质是生物体中普遍存在的一类重要生物大分子，由天然氨基酸通过肽键连接而成。它具有复杂的分子结构和特定的生物功能，是表达生物遗传性状的一类主要...
评级：0 浏览量：9 收藏量：0 资源大小：1.73MB 上传时间：2024-05-20

: pmodel:用于基于蛋白质结构域的遗传变异建模 ### create.sh 在此处创建域区域和非域区域（或无域）的文件。这些将在管道的更下游用于生成表格和相交。 coverage值是可以传递的可选参数，默认值为5。 ### intersect.sh 在此程序中，由create
评级：0 浏览量：51 收藏量：0 资源大小：58KB 上传时间：2021-05-14

: UDoNC：一种基于蛋白质结构域和蛋白质-蛋白质相互作用网络识别必需蛋白质的算法 UDoNC：一种基于蛋白质结构域和蛋白质-蛋白质相互作用网络识别必需蛋白质的算法
评级：0 浏览量：66 收藏量：0 资源大小：1.27MB 上传时间：2021-04-01

: biojs-vis-protein-viewer:显示蛋白质结构域 biojs-vis-protein-viewer 显示蛋白质结构域用法看examples/simple.js贡献欢迎所有贡献。支持如果您有任何问题或建议，请打开问题。执照麻省理工学院许可证版权所有 (c) 2015，特拉维斯·谢泼德 (Travis Sheppard) ...
评级：0 浏览量：119 收藏量：0 资源大小：6KB 上传时间：2021-06-11

: Periaxin蛋白中PDZ结构域的重组表达与纯化 (2012年) Periaxin属于有髓施旺细胞非致密髓鞘中的重要蛋白之一,该蛋白的突变,会引起排骨肌萎缩症4F亚型发生。文章以小鼠periaxin基因为模板,PCR扩增编码Periaxin-PDZ及其延长型的基因序列,插入pETM-3C表达载体中。转入E....
评级：0 浏览量：61 收藏量：0 资源大小：15KB 上传时间：2021-04-27

: DomFun：使用蛋白质结构域和功能注释之间的关联进行蛋白质功能预测它使用在蛋白质结构域和功能注释之间计算的关联作为训练数据集，并通过查找蛋白质的结构域以及它们是否已与功能注释（在GO分子功能，生物学过程，KEGG和Reactome途径术语中）相关联，对蛋白质进行预测（使用UniProt...
评级：0 浏览量：356 收藏量：0 资源大小：32KB 上传时间：2021-02-09

: 使用域间相互作用网络对蛋白质结构域和复杂疾病之间的关联进行优先排序由于蛋白质通常由几个结构域组成，因此可以合理地假设有害的遗传变异可能会改变蛋白质域的结构，影响蛋白质的功能并最终导致疾病。基于这种理解，作者探索了恢复蛋白质结构域与复杂疾病之间关联的可能性。作者...
评级：0 浏览量：107 收藏量：0 资源大小：401KB 上传时间：2021-02-24

: 人HuR蛋白RNA结合结构域初步晶体学研究及其结合poly(U)的特性分析人HuR蛋白RNA结合结构域初步晶体学研究及其结合poly(U)的特性分析，王虹，李恒，人源HuR蛋白是Hu蛋白家族中具有普遍表达性的成员，是一个非常重要的转录后基因表达调控因子。HuR含有三个RRM (RNA recognition motif)...
评级：0 浏览量：92 收藏量：0 资源大小：440KB 上传时间：2020-02-07

: 论文研究 - 双歧杆菌S层蛋白的生物信息学调查这些蛋白质被注释为分布在26种双歧杆菌属中的“ S层（结构域）蛋白”或“假定的S层（y）结构域蛋白”。多重比对表明S层蛋白相对保守。系统发育分析的24个S层（域）蛋白序列将它们分为三个不同的簇，其中大多数...
评级：0 浏览量：98 收藏量：0 资源大小：1.39MB 上传时间：2020-05-27

: 蛋白质结构域折叠类型的离散量理论预测* (2005年) 依据2616个蛋白质结构域折叠类型的分类和PDB库中这些蛋白质的主二级结构序列，计算了这些蛋白质中α螺旋、β折叠和βαβ片段单元的数目，并以此为主要参数构成信息离散源，用离散量方法预测了这些蛋白结构域的折叠...
评级：0 浏览量：63 收藏量：0 资源大小：315KB 上传时间：2021-05-19

: 七鳃鳗组织蛋白酶D成熟肽结构域的原核表达及功能研究七鳃鳗组织蛋白酶D成熟肽结构域的原核表达及功能研究，王红艳，段丹丹，组织蛋白酶D（cathepsin D，缩写CTSD）是溶酶体内天冬氨酸蛋白酶，广泛参与蛋白质的水解过程，在脊椎动物的免疫及消化过程中发挥重要�
评级：0 浏览量：83 收藏量：0 资源大小：390KB 上传时间：2020-01-02

: 论文研究-基于模板匹配与塔式分解的蛋白质结构域分类.pdf 首先构造结构域的距离矩阵灰度图像; 其次建立典型二级结构的距离函数, 并分析所呈现的灰度模式; 然后基于模板匹配和塔式分解, 提出了结构域特征; 最后在结构类和折叠子两个层次实施结构域分类。本方法在第一种验证...
评级：0 浏览量：140 收藏量：0 资源大小：1.35MB 上传时间：2019-07-22

: 用于NMR结构研究的SHP-2蛋白N端SH2结构域的原核制备用于NMR结构研究的SHP-2蛋白N端SH2结构域的原核制备，牛皋，张耀洲，SHP-2蛋白是一种含有两个SH2结构域的磷酸酶，在胚胎发育、血细胞生成和很多生长因子引发的下游通路中起基础作用，与很多疾病的发生�
评级：0 浏览量：78 收藏量：0 资源大小：685KB 上传时间：2020-03-14

: MARVEL结构域家族成员的研究进展 MARVEL结构域家族成员的研究进展，刘宝财，莫晓宁，MARVEL(MAL and related proteins for vesicle trafficking and membrane link) 是新鉴定的四次跨膜结构域。在人类，MARVEL结构域膜蛋白有28个成员，分为五个�
评级：0 浏览量：122 收藏量：0 资源大小：310KB 上传时间：2020-02-21

: domainfacts:统计检测谱系，环境和病原体相关蛋白结构域家族领域事实统计检测谱系，环境和病原体相关蛋白结构域家族DomainFacts是对Pfam域家族进行预先计算的分析的数据库。在Pfam v。32.0中检查了所有17,929个家庭的丰富程度： NCBI（通过Pfam的数据库）环境（人的肠道，...
评级：0 浏览量：65 收藏量：0 资源大小：32KB 上传时间：2021-03-05

: 新城疫病毒F蛋白结构域的原核表达与免疫反应性新城疫病毒F蛋白结构域的原核表达与免疫反应性，张桂芝，陈雪燕，以含新城疫病毒(NDV)融合蛋白(F)基因的重组质粒为模板，通过PCR扩增获得F基因的抗原结构域基因片段Fa，经Sal I和Not I酶切后，定向插入原
评级：0 浏览量：65 收藏量：0 资源大小：275KB 上传时间：2020-02-28

: Lp_1643蛋白单一结构域的黏附功能研究 (2008年) 从植物乳杆菌KLDS 1.0320中克隆出Lp_1643蛋白N端的第一个结构域基因，与表达载体PET30a连接后成功构建重组质粒证pet30A/N1。重组质粒转化大肠杆菌BK21后，以IPTG进行诱导，重组蛋白以可溶形式成功获得表达。通过亲和...
评级：0 浏览量：86 收藏量：0 资源大小：392KB 上传时间：2021-05-28

: 基于距离最大熵值的蛋白质结构域边界检测系统 (2009年) 首次将蛋白质结构域边界检测问题归结为非平衡数据学习问题,提出一种新的欠采样方法,即在支持向量机特征空间中对与正类样本具有距离最大熵值的负类样本进行采样。以经过筛选的蛋白质结构域数据库作为实验数据,支持...
评级：0 浏览量：49 收藏量：0 资源大小：779KB 上传时间：2021-04-29

: 大豆PM2蛋白及其结构域可提高烟草耐盐性 (2007年) 为在高等植物中进一步验证PM2蛋白及22-氨基酸结构域的耐盐功能，将大豆PM2及PM2B基因克隆至植物表达载体pBI121，并利用农杆菌侵染法转化烟草叶盘，通过PCR扩增法鉴定转基因植株。结果表明PM2及PM2B基因已整合至转...
评级：0 浏览量：37 收藏量：0 资源大小：492KB 上传时间：2021-05-22

: 新城疫病毒HN蛋白和F蛋白结构域共表达对细胞融合的影响新城疫病毒HN蛋白和F蛋白结构域共表达对细胞融合的影响，陈亚波，陈雪燕，将重组真核质粒pcDNA3-HN、pcDNA3-HNa、pcDNA3-HNb、pcDNA3-F和pcDNA3-Fa(c)脂质体介导转染HeLa细胞，分别以新城疫病毒阳性血清和制备的...
评级：0 浏览量：134 收藏量：0 资源大小：950KB 上传时间：2020-01-04

: 猪链球菌9型LysM结构蛋白克隆表达及特性分析猪链球菌9型LysM结构蛋白克隆表达及特性分析，邵靓，吴宗福，猪链球菌（SS）是猪的重要病原，同时也是一种人畜共患病原。前期研究发现猪链球菌9型（SS9）一个新的含LysM结构域的黏附相关蛋白（SS
评级：0 浏览量：95 收藏量：0 资源大小：444KB 上传时间：2020-01-02

: Protdraw:创建蛋白质序列的可移植，灵活的结构域图-开源 ProtDraw为输入序列的域结构创建灵活，易于解释和可移植的插图。 ProtDraw随附有makeProtDraw，makeProtDraw是一个帮助程序，该程序在一组指定的隐藏Markov模型上运行hmmer3，并格式化ProtDraw的结果。在重叠的...
评级：0 浏览量：109 收藏量：0 资源大小：983KB 上传时间：2021-04-29

: 用于NMR结构研究的SHP-2蛋白N端SH2结构域的高效率原核制备用于NMR结构研究的SHP-2蛋白N端SH2结构域的高效率原核制备，牛皋，郭江峰，SHP-2蛋白是一种含有两个SH2结构域的磷酸酶。SHP-2的N端SH2结构域是细胞因子或病毒因子激活该蛋白的分子内靶点。对shp2进行信息学分析，
评级：0 浏览量：80 收藏量：0 资源大小：823KB 上传时间：2020-01-04

: 小麦蛋白质二硫键异构酶的结构域对其性质影响研究小麦蛋白质二硫键异构酶的结构域对其性质影响研究，黄政，刘光，小麦蛋白质二硫键异构酶（wPDI）由4个硫氧还蛋白结构域a-b-b'-a'和C-末端c尾组成。为考察wPDI各结构域对其活性的影响，本研究通过亚克隆
评级：0 浏览量：65 收藏量：1 资源大小：645KB 上传时间：2019-12-26

: 一个拟南芥C2H2锌指蛋白的结构域分析 (2009年) At3g23140是拟南芥中仅含有一个C2H2锌指结构的转录因子，主要含有N端的C2H2锌指结构和C端的类似EAR两个结构域。将At3g船I40中仅含C2H2锌指结构区域不同长度的两个基因片段A1（240bp），A2（410bp）克隆到植物表达...
评级：0 浏览量：136 收藏量：0 资源大小：477KB 上传时间：2021-05-15

: 血吸虫血红蛋白降解途径的重构及关键酶蛋白保守结构域的分析 (2011年) 利用生物信息学方法,以疟原虫的血红蛋白降解途径为基础,成功地构建出了日本血吸虫和曼氏血吸虫的血红蛋白降解途径,并对降解途径上的关键酶蛋白的保守结构域进行了序列及结构分析。预测得到的血吸虫血红蛋白降解酶...
评级：0 浏览量：62 收藏量：0 资源大小：2.34MB 上传时间：2021-05-14

: 大豆PM2蛋白11氨基酸结构域的耐盐功能鉴定 (2006年) 大豆PM2蛋白属LEA3（1ate embryogenesis abundant group3）蛋白。以含大豆PM2基因的重组栽体为模板，PCR法扩增出可编码6拷贝11-氨基酸重复序列的基因片段PM2D。构建pET28a/PM2D重组载体，并转化大肠杆菌得到重组菌BL...
评级：0 浏览量：33 收藏量：0 资源大小：1.76MB 上传时间：2021-05-26

: 动蛋白GhKCH2 CH结构域两侧序列对其结合微丝具有重要作用动蛋白GhKCH2 CH结构域两侧序列对其结合微丝具有重要作用，陈子溦，秦兴华，动蛋白是真核生物中广泛存在的依赖于微管的马达蛋白。然而，在动蛋白-14家族中却存在这样一类植物特有的动蛋白，它们的N末端含有�
评级：0 浏览量：68 收藏量：0 资源大小：659KB 上传时间：2020-01-03

: 细胞色素c氧化酶可溶性结构域中Val162突变对蛋白结构和功能的影响 (2003年) 采用蛋白质工程的定点突变技术和UV-V is，CD，荧光，EPR及快速动力学技术考察了与癌症相关的Val162的突变对细胞色素c氧化酶可溶性结构域的影响。研究发现，该突变导致了蛋白二级结构的转化和电子传递活性的降低，这...
评级：0 浏览量：28 收藏量：0 资源大小：98KB 上传时间：2021-05-09

: CH结构域及侧翼序列参与AtKP2与微丝的结合 CH结构域及侧翼序列参与AtKP2与微丝的结合，陈子溦，秦兴华，动蛋白是真核生物中广泛存在的依赖于微管的马达蛋白。然而，在动蛋白-14家族中却存在这样一类植物特有的动蛋白，它们的N末端含有�
评级：0 浏览量：62 收藏量：0 资源大小：426KB 上传时间：2020-01-29

: 水稻CCCH类型锌指蛋白的结构和功能分析水稻CCCH类型锌指蛋白的结构和功能分析，冉莉，杨超，为了初步了解水稻CCCH类型锌指蛋白的结构特点和生物学功能。本研究基于水稻数据库，利用生物学信息学方法，研究了水稻的CCCH类型锌�
评级：0 浏览量：86 收藏量：0 资源大小：373KB 上传时间：2020-02-11

: DORY:用于挖掘KASH蛋白（与SUN域相互作用的蛋白）-开源 ***有关详细信息，请参见以下出版物：Zhou X，Graumann K，Wirthmueller L，Jones JDG，Meier I（2014年），独特的与SUN相互作用的核包膜蛋白的鉴定在植物中具有多种功能。细胞生物学杂志205（5）：677-692。 ...
评级：0 浏览量：75 收藏量：0 资源大小：152KB 上传时间：2021-04-29

: 三叶半夏凝集素C端结构域的可溶表达及其活性研究 (2014年) 利用pFT-32-SUMO表达载体在大肠杆菌中可溶表达三叶半夏凝集素C端结构域(P-D2),并研究其凝血活性、糖结合特异性以及肿瘤抑制活性。实验结果表明,P-D2蛋白的产量为5mg/L。该蛋白具有凝集小鼠红细胞的活性,可以被D-甘露...
评级：0 浏览量：62 收藏量：0 资源大小：1.24MB 上传时间：2021-05-17

: 长型肌球蛋白轻链激酶4Ig结构域的表达及单克隆抗体的制备 (2008年) 长型肌球蛋白轻链激酶(long myosin light chain kinase，L-MLCK)及其分子内结构域的功能还不清楚．在研究其功能时，特异性抗体是一基本工具，但目前国际上还没有制备成功特异性较好的抗体．为此，我们先在大肠杆菌E...
评级：0 浏览量：48 收藏量：0 资源大小：329KB 上传时间：2021-04-24

: Prodar:Prodar在PDB上搜索候选蛋白质结构比对-开源目的是使该工具自动识别原本不同的蛋白质结构中的共同结构域和基序。然后可以使用其他工具在结构上对齐这些文件，以找到RMSD（Prodar会提出建议）。 Prodar鼓励采用互动式的发现方式，在此方式中搜索会Swift完善并...
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