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凋亡蛋白是一组具有特定功能的蛋白,在生物的生长和体内平衡中起着重要作用。 在凋亡过程中,抗凋亡和促凋亡在凋亡的调节中起着不同的作用。 如果抗凋亡蛋白或促凋亡蛋白失活,将导致癌症等疾病的发生。 蛋白质的功能主要取决于其结构。 域是蛋白质的功能区,是保守的。 因此,对抗凋亡蛋白和促凋亡蛋白结构域的分析将有助于我们更好地了解凋亡蛋白的致病机理。 在这项工作中,基于UniprotKB \ SWISS-PROT数据库构建了一个数据集。 该数据库包括239种抗凋亡蛋白和222种促凋亡蛋白。 然后,我们分析了239个抗凋亡蛋白和222个促凋亡蛋白结构域。 最后,我们发现抗凋亡蛋白和促凋亡蛋白中的某些结构域是特定的,其他结构域是常见的。 我们在PDB数据库中找到了域对应的二级结构和三级结构。 HECT和BAG结构域是抗凋亡蛋白的特征。 HECT结构域与乳头瘤病毒E6蛋白相互作用可通过介导P53的降解而引起宫颈癌。 BAG结构域与抗凋亡Bcl-2具有协同作用。 EF-手结构域是可以诱导凋亡的促凋亡蛋白的特征。 蛋白激酶和死亡家族结构域在抗凋亡和促凋亡蛋白中很常见。 通过蛋白磷酸化,凋亡蛋白的蛋白激酶结构
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