分子作用势_下载资源_代码源码-CSDN下载

4_分子间相互作用势.pdf 分子间相互作用势是指不同分子之间的相互吸引力或排斥力，这些力决定了物质的许多物理性质，如沸点、熔点、溶解度、粘度等。分子间相互作用力根据分子的极性可以分为极性分子间的相互作用和非极性分子间的相互作用。...

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5_分子间相互作用势.pdf 在本文档中，我们探讨了分子间相互作用势的概念，这是一个涉及物理化学以及分子动力学的基本知识点。分子间相互作用势是描述分子之间相互作用力的数学表达形式，它是分子间相互作用的本质体现，并且是理解物质状态、...

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purewater_lammps_lammps水分子模拟描述中提到的“lammps分子动力学模拟水分子”，意味着我们将利用LAMMPS来模拟水分子的动力学行为，例如水分子间的相互作用、运动状态、热力学性质等。这种模拟可以模拟从几十到数百万个水分子的团簇，使得研究人员...

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应用ABEEMσπ模型快速计算分子静电势 (2009年) **分子静电势**是由分子体系中所有粒子所产生的相互作用势，具体定义为：\[ V(r) = \sum_{A=1}^{N} \frac{Z_A}{|r-R_A|} - \int \frac{\rho(r')}{|r-r'|} dr' \] 其中，\(V(r)\) 表示分子体系在 \(r\) 处产生的静电...

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水二聚体分子间相互作用势 (2006年) 利用超分子二阶到四阶多体微扰理论和扩展的相关一致基组(aug-cc-pVTZ)结合有效的中点键函数(3s3p2d1f1g)计算水二聚物的平衡结构和分子间相互作用势,并用平衡方法修正基组重叠误差.在MP2/aug-cc-pVTZ理论级别优化水二...

评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：185KB 上传时间：2021-05-07

碱基分子中单电子作用势判断化学键强弱的研究 (2013年) ### 碱基分子中单电子作用势判断化学键强弱的研究 #### 一、引言碱基作为DNA和RNA的基本组成单元，在遗传信息的传递过程中起着至关重要的作用。碱基包括腺嘌呤（Adenine, A）、鸟嘌呤（Guanine, G）、胸腺嘧啶...

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规则星形高分子之间的相互作用势的自洽场研究 (2006年) 用自洽场理论方法计算了星形高分子之间的相互作用势，并与标度理论的推测以及基于粒子的分子动力学模拟方法的结果进行了比较。自洽场理论计算得到的星形高分子之间的二体相互作用势与标度理论推测的结果基本一致： ...

评级：0 浏览量：86 收藏量：0 资源大小：174KB 上传时间：2021-04-29

分子的Morse势振子的准相干态和激光同分子的相互作用 ### 分子的Morse势振子的准相干态和激光同分子的相互作用 #### 概述本文探讨了分子的Morse势振子的准相干态及其与激光的相互作用。作者首先介绍了如何将研究谐振子的相干态方法推广至Morse势振子，并定义了新的...

评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：381KB 上传时间：2021-02-06

用TT势计算的CO分子的相互作用势及输运系数 (2008年) 利用Tang-Toennies势模型(以下简称 TT势) ,计算了CO—CO的相互作用势,在此基础上得到了CO系统的扩散系数、粘滞系数,并将所得相互作用势以及粘滞系数、扩散系数分别与已有结果进行了比较.结果表明TT势模型是一种简单...

评级：0 浏览量：39 收藏量：0 资源大小：190KB 上传时间：2021-05-12

N2-N2二聚物分子间相互作用势的从头算 (2007年) 采用改进的MP2方法和传统的MP2,MP3,MP4方法,结合6-31 + G(2df)、6-311 + G (2df),AUG-cc-pVTZ在内的多种基组对N2-N2分子间相互作用势进行了比较研究．结果表明:用MP4方法计算得到的相互作用势介于MP2与MP3的结果之间...

评级：0 浏览量：62 收藏量：0 资源大小：298KB 上传时间：2021-05-26

氩、铝原子相互作用势的计算及其在飞秒激光烧蚀分子动力学模拟中的应用组合连接短程和长程2种势能函数，得到了Ar-Al相互作用的势能函数，并利用该相互作用势给出了相应小体系和小尺度下飞秒激光烧蚀的分子动力学模拟结果。该模型在Ar、Al原子距离较近时使用Ziegler-Biersack-Littmark...

评级：0 浏览量：116 收藏量：0 资源大小：4.19MB 上传时间：2021-02-04

Lammps分子模拟之聚合物弛豫脚本此外，可能还需要定义非键相互作用，如使用 LJ（Lennard-Jones）势或牛顿第三定律的修正势，以描述聚合物链之间的相互作用。总结来说，LAMMPS通过聚合物弛豫脚本能够精确地模拟聚合物的结构优化，21步压缩弛豫法则...

评级：5 浏览量：1762 收藏量：5 资源大小：517KB 上传时间：2022-03-28

GULP拟合势函数的案例.pdf 在GULP模块的数据库中，有许多不同的力场，其中包含有多种相互作用势函数，从双体相互作用到多体相互作用都包括在内。对于MgO，这里选用Bush力场。将Library改为Bush，并点击View按钮。GULP中的力场文件都以文本文件...

评级：0 浏览量：578 收藏量：1 资源大小：453KB 上传时间：2022-01-09

分子模拟简介:包含简易实践amber分子动力学计算方法通过Amber进行分子模拟，可以预测蛋白质的结构和稳定性，模拟蛋白质-配体相互作用，优化药物设计，以及研究生物大分子的动态构象变化，这在药物研发、生物工程和基础生物学研究中具有广泛应用。此外，分子动力学模拟...

评级：0 浏览量：177 收藏量：0 资源大小：4.34MB 上传时间：2023-05-15

分子动力学基础教程lammps 在LAMMPS中，用户可以定义不同的势能函数，如Lennard-Jones势、库仑势等，以模拟各种类型的原子间相互作用。 **lammps安装教程win下并行.docx** 提供了在Windows环境下安装LAMMPS的并行版本的步骤。安装LAMMPS通常...

评级：1 浏览量：1915 收藏量：12 资源大小：122.44MB 上传时间：2019-10-28

Ne-CH4分子间相互作用势的局域密度近似计算# (2004年) 利用基于密度泛函理论框架下的局域密度近似方法对Ne-CH4分子间的相互作用势进行了计算。发现:当Ne原子和CH4分子之间的距离约为5.8 a.u.时,计算的势能曲线存在最小值,对应的势阱深度约为0.053 eV。计算结果与实验值...

评级：0 浏览量：50 收藏量：0 资源大小：115KB 上传时间：2021-05-11

分子动力学原理:包含简易公式推导与原理实践在经典分子动力学中，粒子间的相互作用通过比较实验数据构建的经验势函数近似处理。这种方式适合模拟仅通过各向同性配对势相互作用的简单粒子，如惰性气体。而对于共价键原子（存在方向性的相互作用）或涉及电子结构...

评级：0 浏览量：55 收藏量：0 资源大小：8.58MB 上传时间：2023-05-15

分子动力学模拟方法概述原子间相互作用势是模拟的关键，Lennard-Jones势(L-J势)是常用的一种，具有两个参数ε和σ，能较好地拟合实验数据如结合能、晶格常数等。Morse势也是一种常用的势能函数，基于双原子分子的振动谱，具有四个参数：...

评级：0 浏览量：582 收藏量：0 资源大小：179KB 上传时间：2010-07-11

分子动力学介绍，，，。在这个过程中，分子间的相互作用通常由势能函数（如EAM、Stillinger-Weber势）来近似表示。在LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）分子动力学模拟器中，我们首先需要对工作环境...

评级：0 浏览量：98 收藏量：0 资源大小：10.39MB 上传时间：2022-03-22

B_Main_分子动力学模拟_ 在本例中，"基于L-R势"表明模拟可能采用了Lennard-Jones势，这是一种广泛用来描述分子间相互作用的势能模型，它可以很好地近似真实气体中的范德华力。 Lennard-Jones势（L-J势）通常表示为12-6势，形式为： \[ V(r...

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带电的AdS黑洞中小分子之间的热分子势 更重要的是，我们研究了带电的AdS黑洞微分子之间的分子电势问题，并明确指出，众所周知的经验Lennard-Jones电势是从热力学角度完全描述黑洞微分子之间相互作用的可行候选人。 Lennard-Jones势所引起的相互作用力的...

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利用ABEEM模型在分子形貌轮廓上计算几个五元环配合物的分子静电势 (2012年) 分子静电势是指分子在空间某一位置产生的分子静电作用势能,分子之间的相互作用可以通过静电势这个物理量来表述.利用ABEEMσπ模型计算出回归到各原子位点的电荷分布,结合自编Fortran 程序可快速计算得到分子的静电势...

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类分子势重层子偶素 (1984年) 在标题中提到的“类分子势重层子偶素 (1984年)”涉及的研究工作，实际上是在层子模型的基础上，尝试引入一种类似分子势的相互作用来描述强子的性质，尤其是对于Y粒子及其家族成员的径向激发能量和轻子衰变宽度比的...

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吸附过程中甲烷分子和煤表面的作用结合甲烷分子的正三角锥、倒三角锥吸附模型和煤表面的势垒,运用量子力学的理论,考虑极限条件下甲烷分子的经典力学特点,建立了甲烷分子在煤表面吸附势作用下的波动方程。同时考虑到甲烷分子虽然不间断地在煤表面吸附...

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lammpsin文件参数文件_lammps力场文件_lammps、in文件、势函数、参数_分子动力学_ 标题和描述提到的“lammps.in”文件是LAMMPS模拟的主要输入文件，而“lammps力场文件”则包含了描述粒子间相互作用的势函数和参数。首先，我们需要理解“lammps.in”文件。这是LAMMPS执行模拟时读取的指令集，包含...

评级：5 浏览量：1427 收藏量：1 资源大小：234KB 上传时间：2021-10-01

LJ-Argon:使用 Lennard-Jones 势对液态氩进行分子动力学模拟 LJ-氩气液氩的模拟。该模拟基于 A. Rahman 1964 年的论文。总之，864 点质量与 Lennard-Jones 势相互作用并遵循经典运动方程。用法 python simulate.py <number>

评级：0 浏览量：252 收藏量：2 资源大小：1.98MB 上传时间：2021-06-27

神经网络势：分子动态构型描述符并与之相互作用）时，我们应该考虑物理系统的对称性。我们已经知道，对于诸如势能之类的问题，我们应该考虑平移，旋转，置换和反射对称性。人们已经为解决这些对称问题做了不同的工作。尽管如此，问题仍然存在...

评级：5 浏览量：200 收藏量：0 资源大小：81KB 上传时间：2021-02-17

云计算-分子、团簇和凝聚体系中相互作用的计算研究.pdf 第三章可能涉及了对更精确分子间势模型的构建及其在C60一维体系中的应用。构建更精确的模型对于准确描述分子间的相互作用至关重要，尤其是在研究如富勒烯这类复杂系统时。通过优化模型，我们可以更好地理解和预测...

评级：0 浏览量：42 收藏量：0 资源大小：3.51MB 上传时间：2022-06-29

原子间相互作用对势计算合金奥氏体结合能* (2006年) 利用量子化学从头计算方法和半经验原子间相互作用对势，并参考“固体与分子经验电子理论”中的合金奥氏体的晶胞模型，计算出Fe-C-Me2x奥氏体晶胞的结合能信息。由计算分析可知：（1）各种合金元素原子与C原子之间的...

评级：0 浏览量：89 收藏量：0 资源大小：4.03MB 上传时间：2021-04-26

LAMMPS实例_；分子模拟_lammps_lammps实例_分子动力学_lammps编程 LAMMPS在分子动力学模拟中提供了丰富的势能函数，如斯莱特型势、埃伦费斯特-范德华斯势、查普曼-恩克尔势等，以描述不同类型的相互作用，包括金属、半导体、液体、生物大分子等。 **LAMMPS实例**通常包含输入文件、...

评级：5 浏览量：1042 收藏量：1 资源大小：3.09MB 上传时间：2021-09-10

HF-He相互作用势及碰撞截面的研究 (2000年) 研究中首先拟合了HF分子与He原子之间的相互作用势。由于之前提出的模型存在缺陷，如缺少特定参数或存在断点区域，研究者在原有模型的基础上进行了改进。通过在断点区域引入新的势能表达式，并对模型进行拟合，使得...

评级：0 浏览量：50 收藏量：0 资源大小：238KB 上传时间：2021-05-08

夸克与夸克反夸克对之间的耦合作用势 (2008年) 在探讨夸克与夸克反夸克对之间的耦合作用势时，涉及到几个关键的物理概念和理论框架。首先，夸克是构成强子（如质子和中子）的基本粒子，每个强子都由三个夸克组成。夸克反夸克对则是由一个夸克和一个相对应的反夸克...

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Ar与HF的相互作用势及分波截面的研究 (2013年) 通过上述方法的研究，本文献成功地获得了Ar-HF分子间的相互作用势，并基于此分析了不同入射能量下分波截面的变化规律。这些研究成果不仅对于理解Ar-HF系统的性质具有重要意义，也为进一步的实验研究提供了理论指导。...

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手性有效场理论中的DD *势和可能的分子态此外，我们通过求解带势的Schrödinger方程来搜索可能的分子态。我们注意到，接触和两点交换势在数值上是不可忽略的，并且对于结合态的存在很重要。在我们的结果中，在截止参数的宽范围内，在I = 0通道中未发现...

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锂与惰性气体相互作用势组合规则的研究 (2006年) 在物理学领域，尤其是在原子分子物理学中，研究原子间相互作用势对于理解物质的性质至关重要。锂属于碱金属元素，在自然界中广泛存在，而惰性气体（如氦、氖、氩等）则因其外层电子壳层已满，表现出极低的化学反应...

评级：0 浏览量：34 收藏量：0 资源大小：2.6MB 上传时间：2021-04-26

5_分子力场方法.pdf 在分子力场方法中，分子被视为由原子组成的集合体，这些原子通过化学键和其他分子间作用力相互作用。分子的自然状态是其键长和键角值处于某个“自然”状态，即最优值。为了达到这种状态，分子需要通过调整其几何形状...

评级：0 浏览量：94 收藏量：0 资源大小：3.05MB 上传时间：2021-09-19

结合编程势函数和神经网络求解材料问题

评级：0 浏览量：35 收藏量：0 资源大小：0B 上传时间：2023-12-05

评论家2：分析分子和固体中的量子化学相互作用尽管电子密度是通常使用的电场批评家2，但是可以使用相同的技术分析任何其他电场（ELF，分子静电势等）。因此，可以计算例如ELF盆内部的电荷或分子静电势的梯度路径。可以使用crime2强大的算术表达式来计算新的...

评级：0 浏览量：73 收藏量：0 资源大小：85.53MB 上传时间：2021-02-13

lammps.rar_lammps_lammps melt_分子动力_分子动力学 2. **相互作用势能**：选择合适的势能函数来描述铜原子间的相互作用，比如EAM（Embedded Atom Method）或LJ（Lennard-Jones）势。 3. **边界条件**：通常采用periodic boundary conditions（周期性边界条件），模拟...

评级：0 浏览量：121 收藏量：1 资源大小：848B 上传时间：2022-09-19

He-HF振转相互作用势及其散射动力学 (2010年) 本文拟合在对称性匹配微扰理论（SAPT）水平下计算的He-HF范德瓦耳斯复合物的相互作用能，获得了He-HF解析振转相互作用势。这个势能面（HF分子的键长取平衡核间距0.091696nm）上存在两个线性极小，即He-HF和He-FH构型...

评级：0 浏览量：76 收藏量：0 资源大小：460KB 上传时间：2021-05-20

BCC.rar_python分子动力_分子动力学_分子动力学 MS_合金建模 7. **势函数**：在分子动力学中，势函数描述了原子间的相互作用，常见的有Lennard-Jones势、EAM势、REBO势等。选择合适的势函数对模拟结果的准确性至关重要。 8. **后处理**：生成的原子坐标文件可用来进行后续分析...

评级：0 浏览量：114 收藏量：0 资源大小：1KB 上传时间：2022-09-20

在红外激光场作用下多原子分子的瞬时离解理论 ### 在红外激光场作用下多原子分子的瞬时离解理论 #### 一、研究背景与意义在红外激光场作用下多原子分子发生的瞬时离解现象引起了广泛关注。这一现象不仅具有同位素选择性，而且还涉及数十个光子的参与过程。...

评级：0 浏览量：48 收藏量：0 资源大小：958KB 上传时间：2021-02-06

s波散射作用下的原子-分子系统的量子动力学研究自旋相反的两成份费米原子-分子耦合系统中,背景粒子...这种粒子间的相互作用在以分子形式存在为主的演化阶段影响明显,其中排斥势散射有利于分子的形成。分子场在系统演化过程中会出现亚泊松(Sub-Poisson)统计分布。

评级：0 浏览量：80 收藏量：0 资源大小：1.29MB 上传时间：2021-02-10

计算物理第1章-基本数学运算.zip_Lennard-Jones势_battle586 在本课程的“计算物理第1章”中，我们探讨了基本数学运算在解决实际物理问题中的应用，特别是在处理分子间相互作用时的关键概念——Lennard-Jones势。Lennard-Jones势是一种广泛使用的理论模型，用于描述非极性分子...

评级：0 浏览量：62 收藏量：0 资源大小：3KB 上传时间：2022-09-23

Al2Cu拉伸变形的分子动力学模拟1 分子动力学模拟作为计算机模拟中非常重要的一种方法，在金属材料领域起着至关重要的作用，尤其在描述微观层次的细节方面。目前，国内外学者在金属材料拉伸的分子动力学模拟方面做了大量的研究工作。 LYNDEN-BELL等...

评级：0 浏览量：197 收藏量：0 资源大小：3.49MB 上传时间：2022-08-03

C 代码进行分子动力学（MD）模拟.rar - MD模拟的核心是分子间相互作用势能，如Lennard-Jones势或EAM势，这些势能模型决定了分子间的吸引力和排斥力。 2. **时间步进** - 在MD中，时间被分成一系列小的时间步（time steps），每个时间步内执行以下操作...

评级：5 浏览量：48 收藏量：0 资源大小：4KB 上传时间：2023-05-27

APBS:生物分子静电软件-开源 APBS是用于Poisson-Boltzmann方程数值解的软件包，该模型是一种流行的连续模型，用于描述各种长度范围内分子溶质之间的静电相互作用。。在下载之前，请先在http://eepurl.com/by4eQr上注册！该站点将在不久的将来...

评级：0 浏览量：617 收藏量：0 资源大小：101.3MB 上传时间：2021-04-28

丙酮分子 n→π*跃迁光谱的平均溶剂静电势 /分子动力学方法研究 (2008年) - **溶剂分子极化率的引入**：通过考虑溶剂分子的极化性，可以更准确地描述溶剂分子与溶质分子之间的相互作用。 #### 结论本研究通过提出新的溶剂化能表达式和光谱移动公式，不仅解决了传统模型中存在的局限性，...

评级：0 浏览量：119 收藏量：0 资源大小：225KB 上传时间：2021-04-29

分子动力学模拟lammps 粘度、表面张力分析in文件 scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款开源的分子动力学模拟软件，广泛应用于材料科学、化学、生物学以及工程等领域，能处理原子、分子和粒子系统的模拟，支持多种相互作用势和算法，具有...

评级：5 浏览量：5215 收藏量：18 资源大小：4KB 上传时间：2019-12-23

“分子动力学模拟及第一性原理计算方法与应用”.pdf 在物理、化学、材料科学、生物医学等领域，分子动力学模拟为研究材料性能、分子间相互作用以及生物大分子的动态行为提供了一种有力的工具。分子动力学模拟的核心是根据经典力学原理对系统的势能面进行建模，并运用...

评级：5 浏览量：3207 收藏量：5 资源大小：1.87MB 上传时间：2019-10-28